97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0030 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4308  putative serine protein kinase, PrkA  84.26 
 
 		 686 aa  1234    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.228625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3341  hypothetical protein  88.23 
 
 		 654 aa  1224    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.830716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1718  putative serine protein kinase, PrkA  80.5 
 
 		 684 aa  1157    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0030  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 		 686 aa  1416    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0714631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0253  putative serine protein kinase, PrkA  79.94 
 
 		 683 aa  1143    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0237  putative serine protein kinase, PrkA  80.53 
 
 		 683 aa  1149    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  21.83 
 
 		 681 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  21.25 
 
 		 690 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  21.25 
 
 		 690 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  21.4 
 
 		 690 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  20.67 
 
 		 690 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  23.72 
 
 		 642 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  24.76 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  24.76 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  20.63 
 
 		 692 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  23.84 
 
 		 644 aa  84  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  21.23 
 
 		 692 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  20.4 
 
 		 692 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  19.97 
 
 		 690 aa  77  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  20.53 
 
 		 694 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  20 
 
 		 690 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  19.81 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  22.47 
 
 		 626 aa  72  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  20.82 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  21.67 
 
 		 632 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  19.65 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  22.57 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  20.91 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  24.3 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2219  putative serine protein kinase, PrkA  22.4 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  19.88 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1379  serine protein kinase, PrkA  22.02 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1412  serine protein kinase, PrkA  22.02 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.405846  normal  0.417288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1396  serine protein kinase PrkA  22.02 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2354  hypothetical protein  22.45 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000221978  normal  0.266981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2100  putative serine protein kinase, PrkA  22.45 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00284243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1991  PrkA serine protein kinase  22.45 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163652  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1890  serine protein kinase, PrkA  22.02 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2071  serine protein kinase, PrkA  22.02 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000277394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2820  putative serine protein kinase, PrkA  22.13 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1977  putative serine protein kinase, PrkA  21.71 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  21.33 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1671  putative serine protein kinase, PrkA  22.11 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.860121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2507  serine kinase family protein  21.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.106478  normal  0.925793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1408  serine kinase family protein  21.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0526547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1849  putative serine protein kinase, PrkA  21.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159984  normal  0.0123748 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1859  putative serine protein kinase, PrkA  21.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00683422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01541  hypothetical protein  22.19 
 
 		 644 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1869  serine kinase family protein  21.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.183837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2007  serine kinase family protein  21.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003981  hypothetical protein  21.87 
 
 		 644 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  22.11 
 
 		 631 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6236  putative serine protein kinase, PrkA  20.68 
 
 		 648 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1463  hypothetical protein  21.44 
 
 		 644 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1961  putative serine protein kinase, PrkA  22.33 
 
 		 644 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.956203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1833  putative serine protein kinase, PrkA  20.87 
 
 		 644 aa  55.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  20.96 
 
 		 650 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  21.59 
 
 		 631 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1638  putative serine protein kinase, PrkA  21.93 
 
 		 644 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112496  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  23.12 
 
 		 631 aa  54.7  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1686  putative serine protein kinase, PrkA  22.45 
 
 		 644 aa  54.7  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01752  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  22.38 
 
 		 602 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2208  putative PrkA serine protein kinase  21.26 
 
 		 644 aa  54.3  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0189439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2882  serine protein kinase  21.49 
 
 		 644 aa  53.9  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2257  putative serine protein kinase, PrkA  21.6 
 
 		 644 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2731  putative serine protein kinase, PrkA  21.79 
 
 		 644 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53743  hitchhiker  0.000511226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6314  hypothetical protein  21.25 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2020  putative serine protein kinase, PrkA  20.62 
 
 		 650 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7069  putative serine protein kinase, PrkA  20.68 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1962  putative serine protein kinase, PrkA  21.61 
 
 		 644 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.771763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1646  putative serine protein kinase, PrkA  21.63 
 
 		 644 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00357576  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2059  serine protein kinase domain-containing protein  20.62 
 
 		 650 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292149  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1774  putative serine protein kinase, PrkA  21.36 
 
 		 644 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000263384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1781  putative serine protein kinase, PrkA  21.36 
 
 		 644 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000025136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2050  putative serine protein kinase, PrkA  20.47 
 
 		 640 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2334  putative serine protein kinase, PrkA  20.62 
 
 		 650 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.562553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1818  putative serine protein kinase, PrkA  21.36 
 
 		 644 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0125883  normal  0.345668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1742  putative serine protein kinase, PrkA  20.47 
 
 		 640 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375663  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  22.28 
 
 		 640 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2561  putative serine protein kinase, PrkA  21.37 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1221  putative serine protein kinase, PrkA  20.82 
 
 		 648 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  23.04 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  21.26 
 
 		 644 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2504  putative serine protein kinase, PrkA  21.36 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000566164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1746  putative serine protein kinase, PrkA  21.21 
 
 		 644 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00635815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2387  putative serine protein kinase, PrkA  22.04 
 
 		 640 aa  48.5  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2158  putative serine protein kinase, PrkA  21.18 
 
 		 644 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.480144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1921  putative serine protein kinase, PrkA  21.43 
 
 		 644 aa  47.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0693234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3553  putative serine protein kinase, PrkA  21.6 
 
 		 640 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3904  putative serine protein kinase  21.05 
 
 		 640 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1710  putative serine protein kinase, PrkA  22.62 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46870  serine protein kinase; PrkA  21.62 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  21.05 
 
 		 640 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0733  putative serine protein kinase, PrkA  22.64 
 
 		 640 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4805  putative serine protein kinase, PrkA  20.99 
 
 		 640 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0731  hypothetical protein  21.75 
 
 		 640 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2446  putative serine protein kinase, PrkA  21.18 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0901471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>