74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2850 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 309 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  26.06 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  27.35 
 
 		 375 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  24.58 
 
 		 375 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.07 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 377 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 		 347 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  23.84 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  24.84 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  23.31 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  22.38 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  26.44 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  22.82 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.87 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  26.87 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 		 534 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  25.77 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.83 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  24.05 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  22.22 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  20.58 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  20 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  29.28 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  27.83 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  22.53 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  25.9 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  22.9 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  24.87 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  23.2 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  24.22 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  21.72 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  24.02 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  24.02 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  20.74 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  38.81 
 
 		 642 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>