More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2191 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  61.44 
 
 
563 aa  698  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  57.48 
 
 
556 aa  655  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  64.8 
 
 
561 aa  733  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  66.18 
 
 
561 aa  722  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  63.77 
 
 
558 aa  707  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  64.27 
 
 
561 aa  719  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  63.41 
 
 
558 aa  692  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  66.49 
 
 
562 aa  751  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  60.83 
 
 
563 aa  695  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.3396e-12 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  65.5 
 
 
561 aa  710  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  53.3 
 
 
675 aa  650  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  59.68 
 
 
561 aa  678  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  66.13 
 
 
566 aa  752  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  76.81 
 
 
559 aa  860  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  63.6 
 
 
561 aa  710  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  54.69 
 
 
561 aa  637  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  63.72 
 
 
561 aa  725  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  63.24 
 
 
561 aa  684  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  6.03701e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  60.4 
 
 
560 aa  666  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  63.77 
 
 
558 aa  707  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  70.8 
 
 
580 aa  824  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  62.45 
 
 
561 aa  685  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  76.63 
 
 
565 aa  866  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  63.77 
 
 
558 aa  707  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  63.73 
 
 
558 aa  711  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
595 aa  1186  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  64.14 
 
 
561 aa  718  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  63.06 
 
 
568 aa  729  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  66.43 
 
 
561 aa  719  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  82.19 
 
 
650 aa  952  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  59.96 
 
 
561 aa  659  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  62.88 
 
 
561 aa  699  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  66.85 
 
 
562 aa  755  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  54.5 
 
 
616 aa  652  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  64.77 
 
 
561 aa  705  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  58.29 
 
 
564 aa  651  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  62.68 
 
 
561 aa  677  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  64.89 
 
 
561 aa  728  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  63.78 
 
 
558 aa  707  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  61.06 
 
 
561 aa  682  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  42.7 
 
 
553 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.54754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
554 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  43.83 
 
 
558 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  43.9 
 
 
554 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  42.59 
 
 
593 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  43.5 
 
 
590 aa  481  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  1.43957e-06 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  43.24 
 
 
631 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  42.4 
 
 
559 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  42.15 
 
 
554 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.45039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
558 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  42.29 
 
 
554 aa  475  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  43.51 
 
 
555 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.00194e-06  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 
560 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.70726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  42.68 
 
 
558 aa  475  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  43.92 
 
 
558 aa  470  1e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 
618 aa  471  1e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
555 aa  469  1e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  43.74 
 
 
558 aa  468  1e-130  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 
554 aa  468  1e-130  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.29126e-07  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
591 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  42.62 
 
 
555 aa  459  1e-128  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 
551 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.7363e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  43.8 
 
 
547 aa  454  1e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  42.51 
 
 
533 aa  453  1e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  41.82 
 
 
555 aa  455  1e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.71 
 
 
644 aa  452  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.41022e-05  unclonable  2.10768e-09 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  40.07 
 
 
555 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
569 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  43.01 
 
 
561 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 
566 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.07 
 
 
555 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  41.91 
 
 
557 aa  441  1e-122  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.56 
 
 
553 aa  441  1e-122  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
556 aa  439  1e-122  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.91 
 
 
557 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.37244e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.63 
 
 
564 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 
560 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  37.73 
 
 
557 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.94402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 
561 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.73 
 
 
557 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  37.73 
 
 
557 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.36 
 
 
557 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.55 
 
 
557 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  40.42 
 
 
569 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  37.73 
 
 
557 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 
557 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0950  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 
619 aa  430  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.92634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  4.19922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29936e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 
556 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
556 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  1.58477e-13 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 
561 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.17 
 
 
555 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  39.12 
 
 
555 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>