41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1073 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  96.28 
 
 		 349 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  100 
 
 		 349 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  49.56 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  51.19 
 
 		 860 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  36.55 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  35.76 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  29.91 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  27.75 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  27.17 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  25.14 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  26.59 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  29.86 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  25.82 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  23.5 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  28.62 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  24.49 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  29.24 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  28.34 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  26.52 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  27.96 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  22.75 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  25.92 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  24.32 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  27.93 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  26.92 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  24.32 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  22.98 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  25.56 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  25.83 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  24.2 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  23.88 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  22.52 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  23.59 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  23.49 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  26.05 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  22.29 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  24.57 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  24.34 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  25.17 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  23.81 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>