More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2438 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  70.56 
 
 
213 aa  279  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  67.04 
 
 
188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  70.89 
 
 
192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  70.25 
 
 
188 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  74.15 
 
 
192 aa  230  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  71.43 
 
 
198 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  49.11 
 
 
208 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  49.11 
 
 
208 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  52.32 
 
 
210 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  50 
 
 
213 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  52.26 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  51.72 
 
 
192 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  47.56 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.04 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  46.85 
 
 
210 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  47.52 
 
 
225 aa  134  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  46.26 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  38.54 
 
 
195 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  47.41 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  44.04 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  43.31 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  43.15 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  46.26 
 
 
192 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  41.56 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  44.59 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  49.25 
 
 
200 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 
196 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  38.5 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  38.5 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 
197 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.03 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  38.5 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  36.13 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.23 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  40 
 
 
225 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  43.54 
 
 
204 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
207 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  43.8 
 
 
224 aa  124  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
185 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 
206 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  47.01 
 
 
199 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 
197 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
189 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.77 
 
 
198 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.97 
 
 
181 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 
203 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  47.01 
 
 
188 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
203 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  43.23 
 
 
195 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  40.79 
 
 
185 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  39.51 
 
 
190 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.76 
 
 
208 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  121  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.4 
 
 
212 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  42.77 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.65 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  38.27 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  47.01 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  38.89 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.88 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  43.97 
 
 
178 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  36.36 
 
 
198 aa  119  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  41.11 
 
 
181 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  36.22 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  40.36 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  41.18 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  41.1 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 
230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  37.38 
 
 
250 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 
230 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  37.38 
 
 
241 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
210 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 
228 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  37.38 
 
 
196 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  37.38 
 
 
196 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  37.38 
 
 
196 aa  117  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>