110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2221 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1599  resB protein  68.1 
 
 
541 aa  796    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  68.1 
 
 
541 aa  795    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  68.1 
 
 
541 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  68.28 
 
 
541 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  68.1 
 
 
541 aa  795    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  66.48 
 
 
542 aa  781    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  67.96 
 
 
538 aa  799    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  68.28 
 
 
541 aa  799    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  68.47 
 
 
541 aa  802    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  68.66 
 
 
541 aa  805    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  68.1 
 
 
541 aa  795    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  100 
 
 
553 aa  1150    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  81.37 
 
 
554 aa  954    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  25.27 
 
 
457 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  25.05 
 
 
452 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  22.95 
 
 
454 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  23.58 
 
 
453 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  24.3 
 
 
455 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  24.85 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  23.16 
 
 
434 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  22.61 
 
 
535 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  22.01 
 
 
457 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  23.78 
 
 
484 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.85 
 
 
426 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  23.51 
 
 
452 aa  96.7  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.36 
 
 
429 aa  94.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  23.87 
 
 
459 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  20.73 
 
 
461 aa  90.1  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  22.49 
 
 
452 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  20.24 
 
 
426 aa  87.8  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  21.69 
 
 
458 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.5 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.85 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  24.25 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  22.72 
 
 
461 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  23.28 
 
 
511 aa  84  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.09 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.65 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  21.5 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  22.87 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  22.52 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  25.08 
 
 
750 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  23.02 
 
 
740 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  22.76 
 
 
738 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  22.07 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  24.38 
 
 
741 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  22.11 
 
 
458 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.83 
 
 
428 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  23.08 
 
 
740 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  22.9 
 
 
738 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  22.16 
 
 
737 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  23.05 
 
 
738 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  22.97 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  22.81 
 
 
670 aa  73.6  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  22.44 
 
 
737 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  23.24 
 
 
733 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  21.91 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  22.44 
 
 
737 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  22.44 
 
 
737 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  21.66 
 
 
678 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  20.6 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  21.54 
 
 
718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  21.54 
 
 
718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  21.54 
 
 
718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  21.54 
 
 
718 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  21.6 
 
 
719 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  21.54 
 
 
725 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  21.54 
 
 
725 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  21.74 
 
 
694 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  23.79 
 
 
660 aa  67  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  22.33 
 
 
679 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  22.08 
 
 
518 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  26.32 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  24.45 
 
 
540 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  22.58 
 
 
742 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  33.94 
 
 
336 aa  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.81 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  22.01 
 
 
614 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  22.01 
 
 
614 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.44 
 
 
596 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  22.44 
 
 
734 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  21.09 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  19.54 
 
 
739 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  21.63 
 
 
734 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  24.2 
 
 
664 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  22.32 
 
 
727 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  34.15 
 
 
724 aa  58.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  22.7 
 
 
544 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  22.22 
 
 
700 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.18 
 
 
432 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  20.42 
 
 
701 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  32.26 
 
 
732 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  21.74 
 
 
717 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  21.74 
 
 
717 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  23.67 
 
 
572 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  21.74 
 
 
603 aa  53.9  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  23.28 
 
 
588 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  26.67 
 
 
578 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  22.12 
 
 
605 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  23.74 
 
 
700 aa  50.4  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>