More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0486 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  100 
 
 
334 aa  685    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  77.25 
 
 
334 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  75.22 
 
 
337 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  74.93 
 
 
337 aa  524  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  75.22 
 
 
337 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  75.22 
 
 
337 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  48.69 
 
 
341 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
341 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  46.53 
 
 
336 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  47.73 
 
 
335 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  44.28 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  45.18 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  43.73 
 
 
324 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 
330 aa  289  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  41.92 
 
 
342 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  43.87 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  54.32 
 
 
265 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  41.14 
 
 
324 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  42.64 
 
 
333 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  40.66 
 
 
326 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  41.02 
 
 
331 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
323 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
261 aa  273  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  41.77 
 
 
324 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
322 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
331 aa  272  7e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 
334 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  40.06 
 
 
328 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  42.51 
 
 
324 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  38.55 
 
 
329 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
321 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  41.9 
 
 
329 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  39.69 
 
 
334 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  41.23 
 
 
320 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  39.69 
 
 
334 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  41.03 
 
 
323 aa  265  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  41.19 
 
 
324 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  37.95 
 
 
337 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
333 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  48.98 
 
 
276 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  39.51 
 
 
330 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  38.37 
 
 
326 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  37.58 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  39.46 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  49.39 
 
 
285 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  43.69 
 
 
317 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.67 
 
 
332 aa  258  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  40.61 
 
 
318 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  38.18 
 
 
328 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
338 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  48.98 
 
 
292 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  40 
 
 
325 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  37.27 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  37.35 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  38.79 
 
 
328 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
328 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  36.83 
 
 
336 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  39.08 
 
 
332 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.58 
 
 
341 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.06 
 
 
342 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
329 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
326 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  37.46 
 
 
331 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  45.66 
 
 
333 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  40.99 
 
 
331 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  39.75 
 
 
331 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  35.71 
 
 
332 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  35.71 
 
 
332 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  40.06 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  40 
 
 
329 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  43.41 
 
 
262 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  43.39 
 
 
326 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
329 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
314 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  36.32 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  29.37 
 
 
338 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.35 
 
 
324 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
308 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.03 
 
 
305 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
324 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.79 
 
 
243 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  36.28 
 
 
360 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  33.47 
 
 
332 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  33.79 
 
 
243 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
266 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  34 
 
 
303 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>