More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0038 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  100 
 
 
317 aa  650  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  97.48 
 
 
317 aa  637  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  74.36 
 
 
319 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  68.05 
 
 
317 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  67.09 
 
 
317 aa  440  1e-122  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  61.29 
 
 
322 aa  401  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  61.02 
 
 
316 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  45.15 
 
 
335 aa  272  5e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  8.55481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  45.22 
 
 
312 aa  268  7e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  43.79 
 
 
366 aa  261  8e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  42.33 
 
 
413 aa  257  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  40.94 
 
 
388 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  41.77 
 
 
387 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  41.07 
 
 
352 aa  254  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.54008e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  43.12 
 
 
387 aa  254  2e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  41.77 
 
 
387 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  41.77 
 
 
387 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  42.14 
 
 
387 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  41.67 
 
 
391 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  41.67 
 
 
391 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  40.06 
 
 
387 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  41.67 
 
 
391 aa  244  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  41.05 
 
 
391 aa  243  2e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  41.05 
 
 
391 aa  243  2e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  41.61 
 
 
387 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  2.64771e-05  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  39.38 
 
 
391 aa  234  1e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  38.77 
 
 
391 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  37.58 
 
 
391 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  39.82 
 
 
509 aa  223  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  37.89 
 
 
391 aa  221  2e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  37.58 
 
 
391 aa  218  8e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  37.84 
 
 
419 aa  216  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  37.82 
 
 
319 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  38.82 
 
 
443 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  35.2 
 
 
362 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  38.1 
 
 
315 aa  209  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  37.42 
 
 
362 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  38.75 
 
 
348 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  36.59 
 
 
354 aa  199  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  35.13 
 
 
337 aa  198  8e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  35.96 
 
 
330 aa  198  9e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  37.78 
 
 
312 aa  197  2e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  34.78 
 
 
343 aa  193  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  34.28 
 
 
346 aa  190  3e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  36.86 
 
 
325 aa  186  4e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  32.59 
 
 
316 aa  179  5e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  36.99 
 
 
320 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2090  ferrochelatase  32.08 
 
 
306 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  35.51 
 
 
348 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0053  ferrochelatase  37.91 
 
 
317 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  34.12 
 
 
344 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  36.28 
 
 
320 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  36.88 
 
 
320 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  32.71 
 
 
345 aa  165  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  32.26 
 
 
357 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  31.66 
 
 
305 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0694  ferrochelatase  33.23 
 
 
303 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  29.81 
 
 
362 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  32.91 
 
 
312 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0772  ferrochelatase  34.28 
 
 
317 aa  155  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.291247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1749  ferrochelatase  30.49 
 
 
313 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.665949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  32.29 
 
 
320 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  30.06 
 
 
348 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  31.33 
 
 
314 aa  155  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  32.39 
 
 
327 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  29.88 
 
 
354 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  29.91 
 
 
370 aa  154  3e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  28.4 
 
 
344 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  31.48 
 
 
371 aa  152  9e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  31.48 
 
 
371 aa  152  9e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2591  ferrochelatase  31.72 
 
 
320 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  31.06 
 
 
344 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  32.1 
 
 
367 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  32.1 
 
 
367 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  32.1 
 
 
367 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  32.2 
 
 
351 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0610  ferrochelatase  32.27 
 
 
303 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.926829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  32.1 
 
 
367 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  31.79 
 
 
364 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  32.31 
 
 
367 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1433  ferrochelatase  32.86 
 
 
303 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  32.31 
 
 
367 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0531  ferrochelatase  32.27 
 
 
309 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.95446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  33.99 
 
 
336 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  28.53 
 
 
360 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  30.72 
 
 
321 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  30.53 
 
 
340 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  30.19 
 
 
352 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  30.06 
 
 
371 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  30.5 
 
 
331 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  33.77 
 
 
345 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  29.55 
 
 
353 aa  148  1e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  28.41 
 
 
357 aa  148  1e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  29.33 
 
 
353 aa  148  1e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  32 
 
 
367 aa  148  1e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  29.94 
 
 
337 aa  148  1e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  30.58 
 
 
371 aa  147  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  30.19 
 
 
352 aa  147  2e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  32.47 
 
 
370 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  30.22 
 
 
355 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>