More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0039 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  97.48 
 
 		 317 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  100 
 
 		 317 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  75 
 
 		 319 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  68.05 
 
 		 317 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  67.09 
 
 		 317 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  61.29 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  61.34 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  44.55 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  45.71 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  44.41 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  43.25 
 
 		 413 aa  262  6.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  42.41 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  41.88 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  41.69 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  43.44 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  42.63 
 
 		 387 aa  252  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  42.46 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  40.38 
 
 		 387 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  41.98 
 
 		 391 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  41.77 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  41.77 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  42.15 
 
 		 391 aa  248  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  41.93 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  41.85 
 
 		 391 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  41.54 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  39.69 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  39.08 
 
 		 391 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  40.71 
 
 		 509 aa  229  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  38.39 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  38.2 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  38.27 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  38.14 
 
 		 419 aa  218  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  39.75 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  38.46 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  35.83 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  38.73 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  38.04 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  39.06 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  36.59 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  36.91 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  35.13 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  35.4 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  37.78 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  34.59 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  37.18 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  33.55 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  36.45 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  37.62 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0053  ferrochelatase  38.56 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2090  ferrochelatase  32.08 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  34.12 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  36.91 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  37.5 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  31.97 
 
 		 305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  32.71 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  32.46 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  30.12 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  32.91 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  31.65 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  32.6 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0694  ferrochelatase  31.96 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0610  ferrochelatase  33.22 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.926829  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0772  ferrochelatase  34.28 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.291247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  32.39 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1749  ferrochelatase  29.66 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665949 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2591  ferrochelatase  31.72 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1433  ferrochelatase  33.22 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  29.75 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  29.88 
 
 		 354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0531  ferrochelatase  33.22 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.95446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  29.28 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  31.37 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  32.2 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  31.48 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  33.77 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  28.83 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  30.82 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  31.48 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  28.53 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  31.35 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  31.79 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  28.4 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  30.19 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  29.62 
 
 		 353 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  28.99 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  33.66 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  31.79 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  31.79 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  29.94 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  31.79 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  29.55 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  30.19 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  31.79 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  30.58 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  30.94 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  32.29 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  32 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1069  ferrochelatase  32.75 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  32 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  30.94 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>