More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3617 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  100 
 
 
362 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  56.3 
 
 
348 aa  362  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  49.57 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  53.91 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  51.3 
 
 
346 aa  322  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  47.45 
 
 
315 aa  299  4e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  42.12 
 
 
337 aa  285  7e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  40.67 
 
 
343 aa  277  2e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  44.12 
 
 
387 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  44.12 
 
 
387 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  44.28 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  42.69 
 
 
387 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  47.4 
 
 
391 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  42.19 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  39.35 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  44.07 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  43.5 
 
 
366 aa  243  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  42.27 
 
 
387 aa  242  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  41.23 
 
 
319 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  43.41 
 
 
388 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  42.86 
 
 
317 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  41.28 
 
 
387 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  41.37 
 
 
509 aa  237  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  42.73 
 
 
387 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  45.02 
 
 
391 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  39.2 
 
 
312 aa  235  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  40.65 
 
 
391 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  40.65 
 
 
391 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  43.64 
 
 
391 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  41.14 
 
 
391 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  41.16 
 
 
391 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  40.67 
 
 
391 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  40.61 
 
 
322 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  39.57 
 
 
391 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  38.04 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  38.96 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  37.42 
 
 
317 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  39.16 
 
 
391 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  40.74 
 
 
443 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  41.47 
 
 
319 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  35.67 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  36.53 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154008  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  33.02 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  40.24 
 
 
320 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  40.55 
 
 
320 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  40.24 
 
 
320 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  35.78 
 
 
413 aa  172  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  35.52 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  30.67 
 
 
330 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  32.51 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0053  ferrochelatase  32.92 
 
 
317 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  29.28 
 
 
314 aa  150  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  30.46 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  32.21 
 
 
370 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  32.62 
 
 
354 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  30.67 
 
 
364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  30.16 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0531  ferrochelatase  29.86 
 
 
309 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.95446  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0610  ferrochelatase  29.86 
 
 
303 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.926829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  31.31 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  30.06 
 
 
337 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  29.14 
 
 
337 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1433  ferrochelatase  29.86 
 
 
303 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  29.14 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  28.36 
 
 
378 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  29.14 
 
 
327 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  29.14 
 
 
337 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  29.14 
 
 
337 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  29.14 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  29.54 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  31.23 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  30.63 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  28.83 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  28.22 
 
 
327 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  29.88 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  27.11 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  35.56 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  29.97 
 
 
367 aa  133  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2316  ferrochelatase  32.66 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  30.12 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1069  ferrochelatase  29.21 
 
 
300 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  30.58 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  28.06 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  29.09 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  28.44 
 
 
345 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  28.35 
 
 
370 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  28.83 
 
 
337 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  31.08 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  28.92 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  30.24 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  31.08 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  30.77 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  30.77 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  30.77 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  30.77 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  31.08 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  32.72 
 
 
354 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  26.59 
 
 
354 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  29.43 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  30.06 
 
 
368 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>