193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0018 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
93 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  94.62 
 
 
93 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  64.63 
 
 
89 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  62.2 
 
 
86 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  64.1 
 
 
86 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  50.59 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  50.6 
 
 
87 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.38 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  48.05 
 
 
284 aa  82  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  46.74 
 
 
106 aa  82.8  2e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  50.65 
 
 
165 aa  81.6  3e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
291 aa  81.6  3e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
296 aa  81.6  3e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  54.05 
 
 
79 aa  81.6  4e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  47.5 
 
 
163 aa  81.3  4e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  48.05 
 
 
322 aa  80.9  5e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
285 aa  80.9  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  48.05 
 
 
304 aa  80.9  5e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  46.84 
 
 
94 aa  81.3  5e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  48.05 
 
 
298 aa  80.9  5e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  48.05 
 
 
334 aa  80.9  5e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  48.05 
 
 
264 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
295 aa  80.5  7e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
299 aa  80.5  7e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  48.1 
 
 
88 aa  79.7  1e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.78 
 
 
88 aa  79  2e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.81458e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.35 
 
 
84 aa  78.2  3e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.35 
 
 
130 aa  78.2  3e-14  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
237 aa  78.6  3e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
77 aa  77.8  4e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.33 
 
 
80 aa  77.8  4e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.65 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  44.16 
 
 
95 aa  77.8  5e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  46.25 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  48.05 
 
 
83 aa  77.4  7e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.71 
 
 
105 aa  77  7e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  46.34 
 
 
107 aa  76.3  1e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  45.68 
 
 
140 aa  76.3  1e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45 
 
 
88 aa  75.9  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.59134e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  45 
 
 
147 aa  75.9  2e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.57 
 
 
91 aa  75.9  2e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  46.75 
 
 
116 aa  75.9  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 
109 aa  75.1  3e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  49.37 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.28421e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  44.44 
 
 
122 aa  75.1  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 
141 aa  74.7  4e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.86 
 
 
84 aa  73.9  6e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.22957e-08  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
289 aa  73.6  9e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  41.03 
 
 
96 aa  72.8  1e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  41.03 
 
 
97 aa  73.2  1e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 
103 aa  72.8  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  45.57 
 
 
80 aa  73.2  1e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.9981e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 
103 aa  72.8  1e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  46.75 
 
 
110 aa  72  2e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  9.51078e-06 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  44.58 
 
 
90 aa  72  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.25 
 
 
166 aa  72.4  2e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 
119 aa  72.8  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 
103 aa  72  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.96 
 
 
90 aa  72  3e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  45.12 
 
 
97 aa  71.6  3e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 
167 aa  71.6  3e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  47.14 
 
 
88 aa  72  3e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
92 aa  71.2  5e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  43.9 
 
 
101 aa  70.5  7e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2194  excinuclease ABC subunit C  46.75 
 
 
96 aa  70.5  8e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  44 
 
 
89 aa  69.7  1e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  51.32 
 
 
151 aa  69.7  1e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  44 
 
 
82 aa  68.9  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  48.72 
 
 
99 aa  69.3  2e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 
84 aa  68.6  2e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
90 aa  68.9  2e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.11 
 
 
80 aa  68.6  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.16284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  50.68 
 
 
86 aa  68.6  3e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
95 aa  68.2  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.16 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  41.89 
 
 
338 aa  68.2  4e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.66383e-11  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
95 aa  68.2  4e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
95 aa  68.2  4e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.37 
 
 
120 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.37 
 
 
120 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.37 
 
 
120 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.37 
 
 
120 aa  67.8  5e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  44 
 
 
82 aa  67.4  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.67 
 
 
96 aa  67.4  6e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  44 
 
 
82 aa  67.4  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 
103 aa  67  8e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 
96 aa  66.2  1e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
120 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.16 
 
 
100 aa  66.2  2e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.37 
 
 
103 aa  65.5  2e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.59 
 
 
100 aa  65.1  3e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.97 
 
 
87 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35 
 
 
96 aa  65.1  4e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 
96 aa  64.7  4e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.97 
 
 
87 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.03 
 
 
88 aa  64.3  5e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>