48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5789 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  924  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  58.77 
 
 
477 aa  405  1e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  38.46 
 
 
385 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  37.12 
 
 
388 aa  199  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  36.21 
 
 
411 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  35.78 
 
 
423 aa  180  5e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  40.32 
 
 
388 aa  175  2e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  36.24 
 
 
396 aa  174  3e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  35.75 
 
 
414 aa  174  3e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  33.85 
 
 
422 aa  173  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  37.44 
 
 
396 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  30.61 
 
 
392 aa  167  3e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  36.7 
 
 
428 aa  166  6e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  38.43 
 
 
415 aa  166  1e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  35.12 
 
 
400 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  31.31 
 
 
412 aa  150  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  34.48 
 
 
418 aa  149  1e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  37.59 
 
 
428 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30.39 
 
 
407 aa  142  1e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  34.6 
 
 
400 aa  142  2e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  34.88 
 
 
407 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  37.28 
 
 
411 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  35.66 
 
 
403 aa  129  1e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  33.83 
 
 
438 aa  129  2e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  33.26 
 
 
443 aa  126  8e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  33.65 
 
 
399 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  35.25 
 
 
372 aa  119  1e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  34.56 
 
 
358 aa  114  4e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  31.64 
 
 
382 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  32.47 
 
 
383 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  33.6 
 
 
412 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  33.6 
 
 
412 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  33.18 
 
 
416 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  33.6 
 
 
369 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  28.34 
 
 
399 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.7 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  29.38 
 
 
381 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  27.62 
 
 
444 aa  86.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.46 
 
 
420 aa  84.7  3e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.06 
 
 
419 aa  73.9  6e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.85 
 
 
401 aa  72.8  1e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  28.65 
 
 
417 aa  70.5  7e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  36.61 
 
 
474 aa  68.9  2e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  20.39 
 
 
399 aa  64.3  5e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.73 
 
 
399 aa  62  3e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  28.93 
 
 
407 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  23.72 
 
 
396 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>