More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0168 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  100 
 
 
304 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  69.34 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  54.61 
 
 
300 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  60.16 
 
 
291 aa  265  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  59.76 
 
 
283 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  53.65 
 
 
291 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  59.64 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  57.98 
 
 
293 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  56.04 
 
 
286 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  52.75 
 
 
314 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  53.16 
 
 
270 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  51.9 
 
 
486 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  52.77 
 
 
286 aa  234  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  52.63 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  52.26 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  55.3 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  52.63 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  52.6 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  58.4 
 
 
269 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  51.1 
 
 
280 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  55.27 
 
 
351 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  54.44 
 
 
282 aa  228  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  57.68 
 
 
309 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  53.21 
 
 
268 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
285 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  55.93 
 
 
315 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  55.8 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  53.05 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 
283 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  50.76 
 
 
311 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 
400 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
259 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  53.23 
 
 
280 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  53.54 
 
 
283 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  44.2 
 
 
274 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
397 aa  209  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  45.71 
 
 
291 aa  207  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  43.43 
 
 
259 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  52.02 
 
 
283 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  54.41 
 
 
315 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  48.34 
 
 
271 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  51.61 
 
 
283 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 
280 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  52.82 
 
 
283 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
306 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
277 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.71 
 
 
285 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.53 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  45.69 
 
 
283 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
283 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  45.69 
 
 
283 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 
291 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  44.75 
 
 
291 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 
268 aa  198  9e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  41.63 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.81 
 
 
287 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
393 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 
277 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
286 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  42.02 
 
 
277 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
277 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  39.55 
 
 
400 aa  195  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  41.25 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  41.25 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  41.25 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  41.25 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  41.25 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  50.2 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 
280 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
274 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
277 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
277 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  41.06 
 
 
282 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.51 
 
 
279 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  40.47 
 
 
286 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  41.63 
 
 
277 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
283 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  43.75 
 
 
817 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 
279 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 
287 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
277 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
277 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 
276 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
394 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.06 
 
 
286 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 
280 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 
277 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
277 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
298 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  41.51 
 
 
394 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>