More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4263 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 		 354 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  75.35 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  67.75 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  65.45 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  63.04 
 
 		 299 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  55.89 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.29 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  54.08 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.46 
 
 		 694 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.26 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.72 
 
 		 358 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.84 
 
 		 357 aa  289  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.31 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.73 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  49.71 
 
 		 365 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.83 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.01 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.76 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.02 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.01 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.68 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  46.93 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  48.77 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.77 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.77 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.32 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.29 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  49.46 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.65 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.64 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.37 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  48.71 
 
 		 291 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  47.1 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  45.56 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  43.13 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.85 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45.93 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.14 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.67 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.64 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  47.48 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.64 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1516  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.64 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.313214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1850  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.27 
 
 		 280 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1719  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.27 
 
 		 280 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.91 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2703  phosphate ABC transporter permease  40.73 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2973  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.13 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.43 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.43 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.43 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.07 
 
 		 296 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.07 
 
 		 296 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3145  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.34 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0014  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.79 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252026  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4150  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.42 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.97 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2166  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.34 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07761  putative phosphate ABC transporter  40.29 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2658  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40 
 
 		 297 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4139  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.43 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.55 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.27 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03554  hypothetical protein  35.71 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07761  putative phosphate ABC transporter  40.65 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.315399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  43.98 
 
 		 288 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0728  phosphate ABC transporter permease  39.93 
 
 		 297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  38.41 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.64 
 
 		 297 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.86 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.86 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.36 
 
 		 296 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  42.86 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08651  putative phosphate ABC transporter  38.63 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.73 
 
 		 298 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7426  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.36 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4265  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.82 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.92 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4210  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.28 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.92 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.92 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  37.55 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4586  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.82 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6688  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.07 
 
 		 304 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.18 
 
 		 300 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2811  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.3 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.108044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>