109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4192 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  100 
 
 		 198 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  90.4 
 
 		 353 aa  346  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  72.86 
 
 		 509 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 		 501 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  28.49 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.76 
 
 		 570 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.8 
 
 		 511 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.25 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.25 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  27.37 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  41.49 
 
 		 424 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.96 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.96 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.11 
 
 		 549 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 		 520 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  33.15 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.87 
 
 		 562 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.07 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.07 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.07 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.07 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.07 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.07 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  36.08 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.49 
 
 		 518 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  24.46 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.64 
 
 		 536 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  29.13 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.06 
 
 		 361 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  28.16 
 
 		 390 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  37.76 
 
 		 336 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4791  IstB ATP binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 284 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  29.7 
 
 		 417 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0194  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2387  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3224  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  36.19 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  34.04 
 
 		 108 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  35.14 
 
 		 509 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  35.14 
 
 		 509 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  37.21 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31560  Transposase  32.17 
 
 		 341 aa  48.5  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49630  helix-turn-helix, Fis-type  32.17 
 
 		 341 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.840005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36480  transposase, helix-turn-helix, Fis-type  32.17 
 
 		 341 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09530  integrase  32.17 
 
 		 341 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0356  integrase catalytic region  36.17 
 
 		 347 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.71 
 
 		 297 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2360  transposase  28.87 
 
 		 106 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00308299  hitchhiker  0.00959569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 495 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 495 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 495 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  58.06 
 
 		 284 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  34.34 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  34.34 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0952  ISRSO3-transposase ORFA protein  31.37 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273706  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  35.87 
 
 		 413 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.08 
 
 		 344 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  29.13 
 
 		 348 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  29.13 
 
 		 348 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  29.59 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 412 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0075  transposase  27.55 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.23 
 
 		 441 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 412 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>