More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3543 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  63.75 
 
 
561 aa  728  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  60.54 
 
 
564 aa  686  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  72.73 
 
 
561 aa  791  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  6.03701e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  60.32 
 
 
560 aa  675  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  66.9 
 
 
565 aa  740  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  67.74 
 
 
561 aa  768  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  66.91 
 
 
559 aa  735  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  68.88 
 
 
561 aa  761  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  66.01 
 
 
561 aa  738  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  62.52 
 
 
561 aa  709  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  64.82 
 
 
561 aa  731  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  67.32 
 
 
561 aa  739  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  63.7 
 
 
563 aa  714  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.3396e-12 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  69.02 
 
 
562 aa  757  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  100 
 
 
561 aa  1118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  69.2 
 
 
562 aa  757  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  87.02 
 
 
561 aa  966  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  57.32 
 
 
561 aa  669  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  64.88 
 
 
561 aa  743  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  63.85 
 
 
563 aa  726  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  70.35 
 
 
561 aa  772  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  68.63 
 
 
561 aa  796  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  72.53 
 
 
561 aa  807  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  64.45 
 
 
650 aa  720  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  67.03 
 
 
561 aa  748  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  67.44 
 
 
568 aa  762  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  64.53 
 
 
566 aa  735  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  71.84 
 
 
561 aa  821  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  63.47 
 
 
580 aa  702  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  65.59 
 
 
595 aa  723  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  67.14 
 
 
561 aa  768  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  57.94 
 
 
556 aa  677  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  55.07 
 
 
616 aa  621  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  54.35 
 
 
675 aa  617  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  56.47 
 
 
558 aa  616  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  55.94 
 
 
558 aa  613  1e-174  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  55.94 
 
 
558 aa  613  1e-174  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  55.94 
 
 
558 aa  613  1e-174  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  54.3 
 
 
558 aa  602  1e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  54.43 
 
 
558 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  45.82 
 
 
558 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  44.79 
 
 
593 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  46.25 
 
 
533 aa  491  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  45.09 
 
 
558 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  42.26 
 
 
560 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.70726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  42.7 
 
 
553 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.54754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  44.48 
 
 
554 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  45.23 
 
 
551 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.7363e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  42.93 
 
 
558 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  43.33 
 
 
555 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.00194e-06  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  43.17 
 
 
554 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
559 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 
558 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 
558 aa  470  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  43.58 
 
 
554 aa  470  1e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.45039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  44.71 
 
 
547 aa  469  1e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  44.34 
 
 
631 aa  470  1e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  44.83 
 
 
556 aa  467  1e-130  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 
555 aa  465  1e-130  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 
555 aa  468  1e-130  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  41.89 
 
 
555 aa  467  1e-130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  44.22 
 
 
557 aa  466  1e-130  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  44.89 
 
 
590 aa  468  1e-130  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  1.43957e-06 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  42.47 
 
 
554 aa  465  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  41.82 
 
 
566 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 
569 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  40.53 
 
 
618 aa  454  1e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.92634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  41.74 
 
 
556 aa  452  1e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  1.58477e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  43.71 
 
 
561 aa  452  1e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  44.17 
 
 
561 aa  454  1e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  4.19922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  43.25 
 
 
644 aa  455  1e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.41022e-05  unclonable  2.10768e-09 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.53 
 
 
555 aa  454  1e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  453  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29936e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  452  1e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  41.97 
 
 
551 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  41.53 
 
 
555 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 
554 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.29126e-07  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
569 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 
556 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  41.34 
 
 
555 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.57483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  41.97 
 
 
551 aa  448  1e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.97 
 
 
555 aa  446  1e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.34 
 
 
555 aa  448  1e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 
583 aa  447  1e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.34 
 
 
555 aa  448  1e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  41.34 
 
 
555 aa  448  1e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  41.34 
 
 
555 aa  448  1e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 
591 aa  446  1e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  41.34 
 
 
555 aa  448  1e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  42.78 
 
 
553 aa  448  1e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.97 
 
 
555 aa  446  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.34 
 
 
555 aa  448  1e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.34796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  41.79 
 
 
551 aa  447  1e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 
561 aa  445  1e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>