More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1289 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  85.32 
 
 
716 aa  1296    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.81 
 
 
699 aa  1004    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  85.32 
 
 
716 aa  1296    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.18 
 
 
716 aa  1291    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.32 
 
 
716 aa  1294    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.85 
 
 
732 aa  1018    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.81 
 
 
699 aa  1004    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  87.14 
 
 
714 aa  1287    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.46 
 
 
726 aa  1043    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.32 
 
 
716 aa  1294    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  85.32 
 
 
716 aa  1296    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.46 
 
 
726 aa  1043    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  65.37 
 
 
715 aa  984    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.46 
 
 
762 aa  1296    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.18 
 
 
716 aa  1293    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  66.67 
 
 
701 aa  979    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  87.29 
 
 
714 aa  1289    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
725 aa  1495    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  87 
 
 
714 aa  1285    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  85.32 
 
 
716 aa  1296    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  87.43 
 
 
714 aa  1290    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.46 
 
 
726 aa  1043    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  87.14 
 
 
714 aa  1287    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.82 
 
 
707 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.42 
 
 
690 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.33 
 
 
690 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.56 
 
 
690 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.42 
 
 
690 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.42 
 
 
690 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.42 
 
 
690 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.42 
 
 
690 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.9 
 
 
690 aa  362  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.37 
 
 
690 aa  362  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.28 
 
 
692 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.24 
 
 
690 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.81 
 
 
690 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.9 
 
 
692 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.94 
 
 
691 aa  353  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.4 
 
 
711 aa  353  8.999999999999999e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.46 
 
 
694 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.19 
 
 
691 aa  350  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.83 
 
 
708 aa  348  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.94 
 
 
691 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  33.95 
 
 
691 aa  348  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.19 
 
 
691 aa  348  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.39 
 
 
703 aa  347  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.2 
 
 
721 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.05 
 
 
686 aa  339  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.84 
 
 
720 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.74 
 
 
714 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.16 
 
 
714 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  34.16 
 
 
714 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.61 
 
 
714 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.75 
 
 
714 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.66 
 
 
700 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.98 
 
 
714 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.48 
 
 
714 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.27 
 
 
712 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.06 
 
 
714 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.06 
 
 
714 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.79 
 
 
714 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.79 
 
 
714 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  32.96 
 
 
750 aa  313  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.54 
 
 
725 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.89 
 
 
710 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.16 
 
 
716 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.37 
 
 
738 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.99 
 
 
692 aa  276  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.8 
 
 
741 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.27 
 
 
758 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.51 
 
 
729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.63 
 
 
664 aa  261  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.98 
 
 
832 aa  232  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.58 
 
 
952 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  25.85 
 
 
822 aa  208  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  26.71 
 
 
667 aa  206  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.85 
 
 
930 aa  203  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.39 
 
 
929 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 
960 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  28.08 
 
 
659 aa  195  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  28.7 
 
 
661 aa  193  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.47 
 
 
934 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.78 
 
 
934 aa  190  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.39 
 
 
934 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.69 
 
 
934 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.86 
 
 
934 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.69 
 
 
934 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.86 
 
 
934 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.86 
 
 
934 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  28.88 
 
 
729 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.55 
 
 
929 aa  187  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  28.55 
 
 
743 aa  187  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  27.96 
 
 
754 aa  185  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.11 
 
 
934 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.23 
 
 
934 aa  185  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.02 
 
 
934 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  27.56 
 
 
843 aa  184  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  27.41 
 
 
636 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  27.41 
 
 
636 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  27.41 
 
 
636 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>