87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0085 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  98.83 
 
 
341 aa  699  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  100 
 
 
341 aa  704  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.01924e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  98.53 
 
 
341 aa  692  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  98.83 
 
 
341 aa  699  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  100 
 
 
341 aa  704  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  98.83 
 
 
341 aa  692  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  99.41 
 
 
342 aa  698  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.41 
 
 
331 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.41 
 
 
331 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.41 
 
 
331 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.09 
 
 
331 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.1402e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  43.09 
 
 
331 aa  266  3e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  38.12 
 
 
338 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  40.12 
 
 
336 aa  221  1e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.94 
 
 
337 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.01 
 
 
337 aa  219  4e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.58 
 
 
335 aa  217  3e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.09 
 
 
336 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.09 
 
 
336 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.09 
 
 
336 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.94 
 
 
337 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.91 
 
 
337 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.91 
 
 
337 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.59 
 
 
337 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.59 
 
 
337 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.59 
 
 
337 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  32.72 
 
 
339 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.12 
 
 
338 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  33.75 
 
 
338 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  33.75 
 
 
338 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.75 
 
 
338 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.44 
 
 
338 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  33.53 
 
 
338 aa  185  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.44 
 
 
338 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.51053e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  31.07 
 
 
336 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  50.34 
 
 
167 aa  145  8e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  28.22 
 
 
326 aa  131  2e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  37.89 
 
 
163 aa  127  2e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  30.49 
 
 
326 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 
331 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  25 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  24.63 
 
 
283 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
272 aa  82.4  1e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
630 aa  82.4  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  26.69 
 
 
328 aa  81.6  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 
278 aa  80.1  5e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
272 aa  77.8  2e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
316 aa  75.5  1e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  28.11 
 
 
336 aa  75.1  2e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  23.65 
 
 
315 aa  74.7  2e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.94 
 
 
274 aa  74.3  3e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
401 aa  69.3  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
401 aa  68.9  1e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  22.31 
 
 
328 aa  68.2  2e-10  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.51 
 
 
276 aa  68.2  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
307 aa  67.8  3e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  23.13 
 
 
300 aa  65.9  9e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  21.32 
 
 
305 aa  65.9  1e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  22.96 
 
 
275 aa  65.1  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
334 aa  65.1  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  23.6 
 
 
280 aa  63.2  7e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  24.91 
 
 
242 aa  61.6  2e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  28.41 
 
 
615 aa  61.2  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  22.39 
 
 
282 aa  60.8  3e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  24.8 
 
 
697 aa  60.1  6e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  25.2 
 
 
273 aa  59.3  8e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  22.49 
 
 
301 aa  59.3  9e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  24.79 
 
 
371 aa  57.8  3e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
319 aa  57.4  4e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  22.94 
 
 
259 aa  56.2  8e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  24.87 
 
 
401 aa  56.2  8e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  7.27163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
381 aa  55.8  9e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
398 aa  55.5  1e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  23.69 
 
 
413 aa  52.8  8e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  25.86 
 
 
602 aa  52  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  24.86 
 
 
342 aa  51.2  3e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  20.1 
 
 
318 aa  50.8  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  20.1 
 
 
318 aa  50.8  3e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  22.74 
 
 
1014 aa  50.8  3e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  22.92 
 
 
347 aa  49.7  7e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  22.9 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.11 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  23.47 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.24419e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.16 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  24.06 
 
 
610 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  30.61 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14752e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>