233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0017 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.238843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  293  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  99.3 
 
 
142 aa  291  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  100 
 
 
133 aa  274  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  88.73 
 
 
142 aa  263  6e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  81.69 
 
 
142 aa  248  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
150 aa  198  2e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
149 aa  197  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  66.19 
 
 
149 aa  188  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  60.56 
 
 
142 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 
154 aa  184  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 
154 aa  184  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  62.22 
 
 
154 aa  184  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3913  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
149 aa  184  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  46.15 
 
 
147 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  50.72 
 
 
137 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
147 aa  132  1e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  50 
 
 
139 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
148 aa  132  2e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 
136 aa  132  2e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  50 
 
 
139 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  50 
 
 
137 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  50 
 
 
139 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  50 
 
 
139 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  47.26 
 
 
145 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  45.14 
 
 
155 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
149 aa  131  4e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  46.58 
 
 
147 aa  130  4e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
156 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  47.83 
 
 
137 aa  130  7e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
156 aa  130  7e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  3.81021e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2170  heat shock protein, Hsp20 family  43.36 
 
 
147 aa  129  1e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
147 aa  129  1e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  46.94 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.29058e-06  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 
147 aa  129  1e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
147 aa  128  2e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
147 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
156 aa  127  5e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
168 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 
146 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  46.21 
 
 
149 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  48.23 
 
 
160 aa  126  8e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  43.06 
 
 
156 aa  126  9e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  43.06 
 
 
156 aa  126  9e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
160 aa  126  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  43.07 
 
 
154 aa  125  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  46.04 
 
 
139 aa  126  1e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
154 aa  126  1e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  45.52 
 
 
149 aa  125  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
155 aa  124  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
162 aa  124  4e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  48.25 
 
 
150 aa  124  4e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 
158 aa  124  4e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  44.03 
 
 
167 aa  124  4e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34300  heat shock protein IbpA  46.62 
 
 
147 aa  124  4e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  43.33 
 
 
152 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.66 
 
 
145 aa  123  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  39.57 
 
 
158 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
146 aa  123  8e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
158 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 
155 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  43.17 
 
 
155 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  42.67 
 
 
152 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  41.73 
 
 
152 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  45.26 
 
 
137 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  42.07 
 
 
156 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  45.26 
 
 
137 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  46.1 
 
 
148 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
153 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  45.26 
 
 
137 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  43.14 
 
 
156 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
147 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  43.57 
 
 
160 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  43.45 
 
 
145 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
160 aa  119  1e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
160 aa  119  1e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>