213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3913 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3913  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  87.14 
 
 
149 aa  260  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  76 
 
 
150 aa  235  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  79.86 
 
 
149 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  77.78 
 
 
142 aa  221  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  71.33 
 
 
154 aa  221  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  71.33 
 
 
154 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  71.33 
 
 
154 aa  221  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  69.34 
 
 
142 aa  200  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  68.12 
 
 
142 aa  199  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  68.12 
 
 
142 aa  199  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  68.12 
 
 
142 aa  199  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  68.12 
 
 
142 aa  199  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  68.12 
 
 
142 aa  199  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
142 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  62.04 
 
 
142 aa  183  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  60.16 
 
 
133 aa  166  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
146 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 
146 aa  137  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  49.29 
 
 
147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  48.2 
 
 
145 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  46.31 
 
 
160 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  44.53 
 
 
148 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  45.27 
 
 
156 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.86 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  45.27 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  45.27 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  48.57 
 
 
160 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  46.72 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 
154 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  46.76 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  47.55 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  45.39 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  47.55 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  45.39 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  46.72 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  44.68 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
160 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  40.79 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  44.6 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  43.33 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  45.99 
 
 
137 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  45.99 
 
 
139 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 
160 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  44.29 
 
 
155 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  45.99 
 
 
139 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  42.21 
 
 
152 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  45.99 
 
 
139 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  45.99 
 
 
139 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 
156 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0763  heat shock protein Hsp20  39.74 
 
 
158 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.50457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
160 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
156 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  42.67 
 
 
158 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
160 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  47.06 
 
 
137 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  44.85 
 
 
137 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1600  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 
169 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000328737  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 
156 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  44.12 
 
 
136 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
152 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
159 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
153 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
167 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.86 
 
 
145 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
162 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  44.74 
 
 
156 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  41.43 
 
 
153 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
152 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  40.14 
 
 
159 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  44.29 
 
 
157 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  41.55 
 
 
154 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  42.66 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2715  heat shock protein Hsp20  43.57 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>