More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0040 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  81.58 
 
 
377 aa  651  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.53 
 
 
378 aa  649  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.26 
 
 
378 aa  645  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.53 
 
 
378 aa  649  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  792  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  60.42 
 
 
383 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.91 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
383 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  47.91 
 
 
383 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
384 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
383 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 
383 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.64 
 
 
383 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.64 
 
 
383 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.64 
 
 
383 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.64 
 
 
383 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.64 
 
 
383 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
381 aa  357  1e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
380 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.09 
 
 
383 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
391 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 
385 aa  256  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  34.63 
 
 
385 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
383 aa  221  2e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
384 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.84 
 
 
384 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
394 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.3 
 
 
380 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 
380 aa  202  1e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
380 aa  201  2e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  31.58 
 
 
380 aa  198  2e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.53 
 
 
379 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.65 
 
 
377 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.97 
 
 
396 aa  190  3e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.1 
 
 
383 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.79 
 
 
379 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.58 
 
 
379 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.29 
 
 
392 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.58 
 
 
385 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.16 
 
 
405 aa  186  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.58 
 
 
383 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.89 
 
 
381 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.84 
 
 
388 aa  185  1e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  9.54759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  185  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29924e-10 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  185  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  185  1e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  185  1e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  185  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  184  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.08426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.18 
 
 
375 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.54 
 
 
383 aa  184  2e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.8 
 
 
385 aa  184  2e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.18 
 
 
375 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.8 
 
 
385 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  183  4e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  183  4e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  183  4e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  183  4e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  183  4e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14865e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  183  4e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.5 
 
 
387 aa  183  4e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  183  4e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  183  4e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  183  5e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  30.97 
 
 
379 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.3 
 
 
384 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.1 
 
 
386 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.5 
 
 
379 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.53 
 
 
380 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
379 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86159e-14 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.97 
 
 
383 aa  182  8e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.59 
 
 
397 aa  182  9e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.1 
 
 
402 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.55 
 
 
381 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>