77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4956 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  312  1e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  312  1e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.76607e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  312  1e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.05362e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  99.36 
 
 
157 aa  310  7e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  98.73 
 
 
157 aa  309  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.01605e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  98.09 
 
 
157 aa  305  1e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  8.57143e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  303  5e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.05331e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  89.81 
 
 
157 aa  286  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  3e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  76.13 
 
 
156 aa  245  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  76.62 
 
 
156 aa  240  4e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  76.62 
 
 
156 aa  240  4e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  74.19 
 
 
156 aa  236  6e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  71.61 
 
 
156 aa  231  2e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  76.62 
 
 
157 aa  229  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  69.48 
 
 
156 aa  223  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  214  3e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.12595e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  100 
 
 
108 aa  214  3e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.81641e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  71.43 
 
 
156 aa  211  3e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  59.24 
 
 
161 aa  193  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  57.96 
 
 
157 aa  190  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  56.6 
 
 
161 aa  186  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  52.63 
 
 
163 aa  172  2e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  49.03 
 
 
159 aa  162  2e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  49.02 
 
 
157 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  49.02 
 
 
157 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  49.02 
 
 
157 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  49.02 
 
 
157 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  48.37 
 
 
157 aa  138  2e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  47.68 
 
 
153 aa  138  4e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  47.06 
 
 
156 aa  137  5e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  3.53059e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  137  8e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  137  8e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  137  8e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  47.06 
 
 
157 aa  137  8e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  46.41 
 
 
156 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  47.06 
 
 
156 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  47.06 
 
 
155 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  46.9 
 
 
157 aa  134  7e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  47.62 
 
 
155 aa  132  2e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  44.83 
 
 
155 aa  129  1e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.18164e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  46.9 
 
 
154 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  44.44 
 
 
154 aa  114  4e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  37.16 
 
 
150 aa  97.8  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  34.93 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  34.27 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  32.9 
 
 
164 aa  78.2  4e-14  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  32.9 
 
 
164 aa  77.4  7e-14  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  32.88 
 
 
174 aa  76.6  1e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  31.03 
 
 
167 aa  77  1e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  31.29 
 
 
161 aa  68.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  35.88 
 
 
159 aa  68.9  3e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  28.97 
 
 
171 aa  67.8  6e-11  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  30.41 
 
 
177 aa  67.4  8e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  65.9  2e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  65.9  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  29.92 
 
 
168 aa  63.5  1e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  28.91 
 
 
193 aa  58.5  3e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  27.97 
 
 
426 aa  56.2  2e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  29.73 
 
 
156 aa  54.7  5e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  8.20605e-07 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  29.55 
 
 
478 aa  53.5  1e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  26.95 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  31.78 
 
 
440 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  28.42 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  32.26 
 
 
637 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.49992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  27.66 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2819  hypothetical protein  31.3 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162218  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  27.07 
 
 
158 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  25.25 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  32.14 
 
 
152 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.47321e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>