61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3060 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3060  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  100 
 
 		 74 aa  151  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0123467  decreased coverage  0.000000000163909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0986  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  98.65 
 
 		 74 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4313  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  98.65 
 
 		 74 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.927484  hitchhiker  0.00014767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3162  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.52 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1833  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.52 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1348  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0302261  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3840  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.86 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0916  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  45.71 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000414298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2787  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116228  normal  0.0228649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0875  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0418872  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3059  DksA/TraR family protein  43.24 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386172  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3507  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119963  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2877  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  43.24 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.53 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.23 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.23 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  36 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2675  hypothetical protein  41.54 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  43.55 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0690  hypothetical protein  44.12 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2983  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000187823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2947  hypothetical protein  55.56 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  39.73 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0030  conjugal transfer protein TraR  36.11 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  67.74 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2120  hypothetical protein  52.5 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.40904  normal  0.833846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01750  hypothetical protein  42.59 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1292  hypothetical protein  38.57 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0645642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2397  hypothetical protein  52.78 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0374  hypothetical protein  39.06 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1690  hypothetical protein  40.32 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64410  hypothetical protein  39.71 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  39.19 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5590  hypothetical protein  39.71 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4228  hypothetical protein  43.64 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0268  hypothetical protein  39.66 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0666  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.1 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0124  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0133  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0861  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3428  hypothetical protein  38.71 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0973  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0920  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3053  DnaK suppressor protein  39.39 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01805  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  56.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>