More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3075 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  52.93 
 
 
1006 aa  969    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  75.99 
 
 
968 aa  1514    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  100 
 
 
989 aa  2024    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  46.1 
 
 
679 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.57 
 
 
684 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  31.03 
 
 
672 aa  278  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2228  hypothetical protein  49.81 
 
 
299 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
292 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  48 
 
 
290 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  45.49 
 
 
318 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  48.18 
 
 
300 aa  233  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  45.52 
 
 
287 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  49.28 
 
 
290 aa  231  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  45.16 
 
 
295 aa  227  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  48.53 
 
 
291 aa  211  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  24.48 
 
 
762 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2227  hypothetical protein  39.64 
 
 
288 aa  128  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  20.91 
 
 
771 aa  121  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  30.33 
 
 
817 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  24.18 
 
 
351 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  33.97 
 
 
247 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.5 
 
 
242 aa  95.5  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.44 
 
 
242 aa  94  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0269  hypothetical protein  26.34 
 
 
435 aa  93.2  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
288 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  39.44 
 
 
252 aa  89.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
253 aa  86.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.62 
 
 
259 aa  86.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.32 
 
 
267 aa  87  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  25.87 
 
 
730 aa  86.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.62 
 
 
244 aa  85.9  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.61 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.32 
 
 
254 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.8 
 
 
254 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  25.2 
 
 
709 aa  83.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  25.2 
 
 
709 aa  83.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  25.2 
 
 
709 aa  83.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  35.56 
 
 
272 aa  82  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.62 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.62 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.18 
 
 
674 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.09 
 
 
390 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.92 
 
 
242 aa  80.5  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.86 
 
 
273 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.48 
 
 
253 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3522  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  30 
 
 
298 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.14 
 
 
255 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.9 
 
 
348 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  32.9 
 
 
349 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5267  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  29.76 
 
 
298 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.96 
 
 
270 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.49 
 
 
282 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.96 
 
 
270 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.94 
 
 
254 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.48 
 
 
259 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.48 
 
 
252 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
252 aa  79  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  30.77 
 
 
236 aa  79  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.76 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  32.9 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
251 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.33 
 
 
248 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
267 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
267 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  33.58 
 
 
302 aa  77.4  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.62 
 
 
256 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1953  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.37 
 
 
336 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.32 
 
 
407 aa  76.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  31.52 
 
 
280 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  33.96 
 
 
269 aa  76.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
252 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.48 
 
 
251 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
392 aa  77  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.9 
 
 
275 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  34.85 
 
 
300 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.97 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.24 
 
 
241 aa  76.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.82 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.91 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  36.62 
 
 
255 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.85 
 
 
251 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.83 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.02 
 
 
253 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.56 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  32.9 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.73 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  32.08 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.45 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  30.82 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.88 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.08 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>