More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1953 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1953  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
336 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2093  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.7 
 
 
275 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.269505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  35.34 
 
 
280 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.83 
 
 
284 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  40.42 
 
 
272 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.42 
 
 
259 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.68 
 
 
282 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.59 
 
 
282 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2835  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.58 
 
 
278 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2316  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.91 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2459  thiF protein, putative  42.37 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.32 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  34.27 
 
 
272 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2153  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.85 
 
 
267 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.779112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.8 
 
 
294 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.05 
 
 
443 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.21 
 
 
281 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.52 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.08 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1706  ThiF protein, putative  34.26 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1679  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.86 
 
 
226 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.74 
 
 
247 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  33.48 
 
 
232 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.87 
 
 
244 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  29.95 
 
 
236 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.6 
 
 
246 aa  101  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.55 
 
 
225 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1858  molybdopterin biosynthesis MoeB protein, putative  28.94 
 
 
333 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0187  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.74 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.635564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  30.33 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.53 
 
 
253 aa  96.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.04 
 
 
226 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272432  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  35.37 
 
 
989 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.18 
 
 
243 aa  95.9  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.2 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  37.14 
 
 
233 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  34.84 
 
 
252 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  39.64 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  31.8 
 
 
269 aa  94  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  35.65 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.36 
 
 
237 aa  92.8  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.88 
 
 
251 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  25 
 
 
367 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  34.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.31 
 
 
249 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.83 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.45 
 
 
244 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.99 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.87 
 
 
249 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0089  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.51 
 
 
266 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  31.17 
 
 
679 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  29.86 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.24 
 
 
223 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  32.14 
 
 
257 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.02 
 
 
243 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.09 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.54 
 
 
252 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  25.22 
 
 
260 aa  89.7  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  34.32 
 
 
248 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  32 
 
 
235 aa  89.4  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.27 
 
 
255 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  35.5 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.24 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.3 
 
 
251 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.69 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.83 
 
 
379 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.29 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.05 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.4 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.7 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.56 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  35.5 
 
 
252 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.32 
 
 
239 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  35.26 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  34.91 
 
 
252 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.85 
 
 
255 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  33.93 
 
 
267 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.69 
 
 
684 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.85 
 
 
255 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.17 
 
 
253 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.5 
 
 
268 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.8 
 
 
266 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.83 
 
 
355 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
386 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  25.71 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  34.91 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.29 
 
 
275 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.64 
 
 
260 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.05 
 
 
246 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  36.31 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.49 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.65 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
236 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>