58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2173 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  60.75 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  49.02 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  56.48 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  52.04 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  47.73 
 
 		 95 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  35.58 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  51.65 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  46.67 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  36.19 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  35.24 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06990  Branched-chain amino acid transport protein (AzlD)  39.09 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000152446  normal  0.417742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  36.67 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  32.41 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  32.41 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  31.73 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  34.74 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  48.48 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  36.07 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  38.95 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  38.1 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.29 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  40.43 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  44.83 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  31.87 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  23.81 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  24.53 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  34.07 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  32.08 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  31.68 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  39.77 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  30.69 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  37.7 
 
 		 103 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  38.18 
 
 		 108 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  34.34 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>