17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2596 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 103 aa  201  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  61.18 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  42.11 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  42.11 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  41.05 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  45.45 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0649  branched-chain amino acid transport  44.33 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000140027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  39.51 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2544  branched-chain amino acid transport  38.37 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000678666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  34.07 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  38.81 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  43.4 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  37.7 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  29.7 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>