More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1379 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 87 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  77.27 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  77.53 
 
 		 89 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  74.68 
 
 		 83 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  75.71 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  62.92 
 
 		 84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  72.86 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 92 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  62.34 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  62.34 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  67.57 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  71.43 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>