More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1015 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  64.36 
 
 
725 aa  990    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
759 aa  1517    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  57.5 
 
 
720 aa  875    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  72.16 
 
 
725 aa  1113    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  58.26 
 
 
722 aa  862    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  58.02 
 
 
743 aa  843    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  72.39 
 
 
732 aa  1114    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  56.91 
 
 
723 aa  832    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  57.85 
 
 
717 aa  889    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  39.29 
 
 
844 aa  548  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  39.84 
 
 
724 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  38.79 
 
 
829 aa  534  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  40.35 
 
 
711 aa  525  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  45.44 
 
 
680 aa  525  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  39.39 
 
 
712 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  39.76 
 
 
712 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  38.23 
 
 
712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  39.49 
 
 
688 aa  513  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  48.36 
 
 
680 aa  515  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  39.6 
 
 
713 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  38.91 
 
 
712 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  38.27 
 
 
712 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  35.66 
 
 
717 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  39.25 
 
 
741 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  37.29 
 
 
743 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  33.92 
 
 
822 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  39.4 
 
 
738 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  36.38 
 
 
713 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  38.23 
 
 
747 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  39.77 
 
 
753 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  38.06 
 
 
826 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  45.86 
 
 
676 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  35.92 
 
 
718 aa  458  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  43.25 
 
 
666 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  37.1 
 
 
728 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  38.66 
 
 
740 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  35.43 
 
 
741 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  45.41 
 
 
676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  38.73 
 
 
740 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  34.44 
 
 
711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  35.94 
 
 
698 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  41.53 
 
 
666 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  39.31 
 
 
669 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  38.95 
 
 
669 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  32.31 
 
 
700 aa  422  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  40.33 
 
 
665 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  34.07 
 
 
700 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  33.42 
 
 
696 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 
711 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  39.3 
 
 
662 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  39.11 
 
 
662 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  39.67 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  39.67 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  39.3 
 
 
662 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  39.67 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  39.38 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  39.67 
 
 
662 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  39.11 
 
 
662 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  43.48 
 
 
649 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  40.22 
 
 
753 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  36.79 
 
 
697 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  35.46 
 
 
776 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 
716 aa  388  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 
780 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  33.25 
 
 
665 aa  389  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  35.85 
 
 
665 aa  387  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  38.58 
 
 
715 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  40.07 
 
 
665 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  39.06 
 
 
721 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  41.18 
 
 
664 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  33.64 
 
 
716 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  40.22 
 
 
668 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  38.22 
 
 
664 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  37 
 
 
662 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  38.22 
 
 
664 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  36.83 
 
 
662 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  33.51 
 
 
699 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  38.04 
 
 
704 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  34.28 
 
 
786 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  33.72 
 
 
722 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  33.85 
 
 
766 aa  363  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  35.18 
 
 
778 aa  362  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  31.64 
 
 
708 aa  362  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  32.14 
 
 
774 aa  362  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  38.56 
 
 
669 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  35.69 
 
 
674 aa  361  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  30.87 
 
 
783 aa  361  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 
705 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  37.08 
 
 
631 aa  359  9e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 
766 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  40.91 
 
 
770 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  32.99 
 
 
712 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  31.88 
 
 
774 aa  357  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  40.73 
 
 
770 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  37.11 
 
 
631 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 
699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  36.51 
 
 
628 aa  354  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  38.23 
 
 
714 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  36.31 
 
 
667 aa  354  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>