More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0612 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
436 aa  877    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  82.43 
 
 
419 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.01 
 
 
419 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.5 
 
 
423 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.44 
 
 
456 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.99 
 
 
419 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.89 
 
 
418 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.01 
 
 
416 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.17 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.33 
 
 
418 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.85 
 
 
418 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.53 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.89 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.18 
 
 
434 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
417 aa  445  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.49 
 
 
423 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.64 
 
 
417 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 
418 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
446 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
418 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.39 
 
 
418 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
418 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.64 
 
 
419 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.16 
 
 
424 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0212  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.42 
 
 
427 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.58 
 
 
418 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
420 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.96 
 
 
423 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.47 
 
 
419 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.52 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.64 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.92 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.14 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0227  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.77 
 
 
428 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.287759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 
425 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.72 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.43 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.79 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
426 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.22 
 
 
426 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
417 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0225  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.85 
 
 
427 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
423 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.4 
 
 
418 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
426 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
458 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
458 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
435 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
458 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.81 
 
 
415 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.81 
 
 
415 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.48 
 
 
425 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.81 
 
 
415 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
435 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0236  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.85 
 
 
427 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
458 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
458 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
425 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
423 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.52 
 
 
416 aa  391  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.79 
 
 
421 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
436 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
423 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.2 
 
 
428 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
423 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.82 
 
 
415 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
415 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
423 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
415 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  47 
 
 
441 aa  391  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
426 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 
421 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
421 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
426 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
426 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 
415 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
437 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
426 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 
421 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.68 
 
 
414 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
415 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.93 
 
 
429 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>