More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0547 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 325 aa  661    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  67.08 
 
 		 324 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  42.94 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  42.64 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  42.94 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  42.94 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  42.94 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  42.94 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  42.94 
 
 		 323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  42.33 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  42.33 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.33 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  39.58 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  39.33 
 
 		 329 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  39.08 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1692  sucrose operon repressor ScrR  39.69 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.3 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  39.26 
 
 		 325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  38.49 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.02 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1329  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  38.23 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1852  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0463476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 337 aa  198  9e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.65 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1342  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  34.86 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  35.35 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  32.74 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 349 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.79 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 344 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  32.11 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  34.62 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  34.62 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.38 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.33 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.14 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.01 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2803  regulatory protein LacI  33.64 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.578503  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.44 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.34 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.25 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.91 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.76 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  35.78 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  33.23 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.17 
 
 		 386 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.54 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.44 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.23 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.45 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  32.73 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  32.73 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  32.73 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.74 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.26 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.53 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 		 343 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.04 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.74 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.74 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  34.39 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.24 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.74 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  34.34 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  36.87 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>