186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1950 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  100 
 
 
244 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  55.79 
 
 
248 aa  271  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  47.21 
 
 
238 aa  224  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  46.91 
 
 
245 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  49.78 
 
 
237 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  44.35 
 
 
240 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  47.08 
 
 
239 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  44.02 
 
 
238 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  44.83 
 
 
241 aa  198  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  44.02 
 
 
238 aa  198  8e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  42.22 
 
 
240 aa  184  1e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.19827e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  39.24 
 
 
239 aa  179  3e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  37.55 
 
 
245 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  38.63 
 
 
251 aa  171  8e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  38.3 
 
 
247 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  38.3 
 
 
254 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  38.3 
 
 
254 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  37.87 
 
 
254 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  37.87 
 
 
248 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.75833e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  41.15 
 
 
251 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  37.87 
 
 
254 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  38.63 
 
 
252 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  37.83 
 
 
245 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.86023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  166  3e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  37.72 
 
 
249 aa  166  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  38.72 
 
 
248 aa  166  3e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  39.56 
 
 
252 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  4.4786e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  37.83 
 
 
245 aa  164  1e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  35.34 
 
 
245 aa  163  2e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  37.83 
 
 
245 aa  163  2e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  35.53 
 
 
245 aa  162  4e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  35.53 
 
 
245 aa  162  5e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  35.53 
 
 
245 aa  162  5e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  37.07 
 
 
244 aa  161  8e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  41.82 
 
 
246 aa  161  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  36.4 
 
 
245 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  34.05 
 
 
245 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  36.4 
 
 
245 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  40.91 
 
 
260 aa  158  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  37.44 
 
 
251 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  36.4 
 
 
245 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  36.12 
 
 
250 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  36.63 
 
 
251 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  39.11 
 
 
252 aa  153  3e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  39.11 
 
 
252 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  35.56 
 
 
243 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  34.19 
 
 
250 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  36.07 
 
 
242 aa  146  4e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.35059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  36.05 
 
 
235 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  37.38 
 
 
247 aa  141  1e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  34.51 
 
 
236 aa  135  7e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  32.16 
 
 
243 aa  119  5e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  33.05 
 
 
580 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  32.2 
 
 
578 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  31.36 
 
 
578 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  31.66 
 
 
246 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  30.8 
 
 
574 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  31.91 
 
 
614 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  31.2 
 
 
562 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  28.63 
 
 
574 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  31.49 
 
 
588 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  30.77 
 
 
650 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  30.77 
 
 
642 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  29.79 
 
 
592 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  31.08 
 
 
577 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  28.69 
 
 
598 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  28.57 
 
 
576 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  33.9 
 
 
576 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  27.66 
 
 
594 aa  91.7  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
560 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  27.66 
 
 
578 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.11495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  30.29 
 
 
578 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.51601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  28.81 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  25.47 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  29.24 
 
 
573 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  27.78 
 
 
588 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  29.36 
 
 
574 aa  89.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  29.24 
 
 
574 aa  89  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  28.51 
 
 
586 aa  88.6  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  28.21 
 
 
572 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  28.21 
 
 
572 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  28.94 
 
 
579 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  28.21 
 
 
573 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.0928e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  27.78 
 
 
573 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.26901e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  28.21 
 
 
572 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  28.21 
 
 
573 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.48289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  29.61 
 
 
569 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  28.63 
 
 
572 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  28.63 
 
 
572 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  27.78 
 
 
573 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>