165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001195 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  100 
 
 
251 aa  524  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  88.05 
 
 
251 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  71.54 
 
 
250 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  68.02 
 
 
247 aa  359  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  60.57 
 
 
248 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  45.64 
 
 
252 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  43.85 
 
 
252 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  43.15 
 
 
254 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  43.15 
 
 
254 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  43.15 
 
 
254 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  43.15 
 
 
254 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  44.13 
 
 
247 aa  224  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  43.21 
 
 
251 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  44.67 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  43.03 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  43.75 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  46.06 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  43.5 
 
 
250 aa  211  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  42.39 
 
 
251 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  41.63 
 
 
245 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  45.23 
 
 
252 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  41.63 
 
 
245 aa  208  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  40.98 
 
 
249 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  41.63 
 
 
245 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  44.1 
 
 
241 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  39.59 
 
 
245 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  39.59 
 
 
245 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  39.59 
 
 
245 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  39.59 
 
 
245 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  41.42 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  39.59 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  40.41 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  40.49 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  39.42 
 
 
245 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  39 
 
 
245 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  37.96 
 
 
245 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  37.96 
 
 
245 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  37.96 
 
 
245 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  40 
 
 
245 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  39.18 
 
 
245 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  40 
 
 
245 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  39.92 
 
 
240 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  37.3 
 
 
244 aa  181  7e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  41.1 
 
 
237 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  40.74 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  35.56 
 
 
238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  37.71 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  35.15 
 
 
239 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  37.29 
 
 
238 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  37.44 
 
 
244 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  35.17 
 
 
235 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  34.16 
 
 
243 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  34.03 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  33.9 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  31.06 
 
 
236 aa  125  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  29.34 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  29.02 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.88 
 
 
580 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  29.28 
 
 
381 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  25.7 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  25.93 
 
 
586 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  30.14 
 
 
578 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  26.51 
 
 
557 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  29.19 
 
 
578 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  26.94 
 
 
573 aa  68.6  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  27.52 
 
 
598 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  27.73 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  28.23 
 
 
576 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  28.46 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  28.23 
 
 
576 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  27.98 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  30.88 
 
 
570 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 
583 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  25.4 
 
 
614 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  25.57 
 
 
574 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
570 aa  62  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  26.19 
 
 
642 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  25.88 
 
 
592 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  26.95 
 
 
576 aa  62  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  27.91 
 
 
570 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  26.57 
 
 
584 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  26.19 
 
 
650 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  26.34 
 
 
532 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  24.02 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  25.78 
 
 
349 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  24.03 
 
 
594 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  24.89 
 
 
578 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  28.1 
 
 
577 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  25.71 
 
 
572 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  25.12 
 
 
579 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  30.72 
 
 
335 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  30.33 
 
 
586 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  31.4 
 
 
563 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  26.69 
 
 
571 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>