145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0344 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  73.98 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  71.54 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  66.27 
 
 		 247 aa  348  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  60.98 
 
 		 248 aa  317  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  47.15 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  45.2 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  46.75 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  45.6 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  45.6 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  45.2 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  45.2 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  45.2 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  46.67 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  44.4 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  44.4 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  43.6 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  46.67 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  46.25 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  46 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  45.6 
 
 		 252 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  44.8 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  43.39 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  42.5 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  44.17 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  44.98 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  43.2 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  43.33 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  42.5 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  41.25 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  41.25 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  39.74 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  38.59 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  38.24 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  38.82 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  41.6 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  37.6 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  41.95 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  39.92 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  38.75 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  34.75 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  34.87 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  34.75 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  34.19 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  31.76 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  31.76 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  31.91 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  29.46 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  28.1 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  25.58 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  25.73 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  25.58 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  27.56 
 
 		 578 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.39 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  27.44 
 
 		 573 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  28.24 
 
 		 580 aa  62.4  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  26.14 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  27.14 
 
 		 598 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  26.96 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  28.9 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  25.37 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.01 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  26 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  28.1 
 
 		 557 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  31.18 
 
 		 583 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06190  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  27.81 
 
 		 570 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  28.24 
 
 		 571 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  26.55 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  30.06 
 
 		 563 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  29.27 
 
 		 592 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  26.69 
 
 		 339 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  24.39 
 
 		 574 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  27.05 
 
 		 586 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  24.68 
 
 		 569 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  25.7 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  25.61 
 
 		 335 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  27.88 
 
 		 570 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1608  histidinol-phosphatase  28.69 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  26.79 
 
 		 576 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  26.05 
 
 		 574 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  23.98 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  26.64 
 
 		 642 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  23.53 
 
 		 334 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  23.53 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03330  hypothetical protein  24.53 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230804  unclonable  6.29446e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>