172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1369 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  91.97 
 
 		 254 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  91.97 
 
 		 254 aa  470  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  91.57 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  91.57 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  87.25 
 
 		 252 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  85.32 
 
 		 252 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  87.65 
 
 		 252 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  86.85 
 
 		 252 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  73.28 
 
 		 249 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  76.42 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  71.37 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  71.66 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  74.19 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  70.46 
 
 		 247 aa  359  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  63.52 
 
 		 245 aa  329  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  63.07 
 
 		 245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  62.7 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  62.7 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  62.7 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  60.66 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  64.53 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  59.02 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  63.52 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  62.7 
 
 		 245 aa  305  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  298  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  56.84 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  46.37 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  50.42 
 
 		 245 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  47.95 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  49.11 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  46.96 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  43.21 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  43.62 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  44.4 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  44.21 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  43.22 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  40.85 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  42.19 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  44.64 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  40.25 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  41.84 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  38.36 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  42.13 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  41.88 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  38.63 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  34.19 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  31.6 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  33.73 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  26.25 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  28.17 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  32.19 
 
 		 580 aa  89  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  31.68 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  27.63 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 577 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  27.69 
 
 		 573 aa  79  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.05 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  28.16 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  29.39 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.34 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  25.76 
 
 		 598 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  28.22 
 
 		 574 aa  68.6  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  29.67 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  28.51 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  30.24 
 
 		 557 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  27.83 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  26.61 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  32.12 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  26.95 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  28.71 
 
 		 580 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  25 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  29.13 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 614 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  28.71 
 
 		 580 aa  62  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  27.39 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  31.55 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  23.37 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  30.88 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  30.88 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  28.22 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  27.38 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 		 583 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  25.21 
 
 		 572 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  29.49 
 
 		 592 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  27.27 
 
 		 642 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  27.27 
 
 		 650 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>