197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0111 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  68.07 
 
 		 239 aa  352  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  57.5 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  48.94 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  48.32 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  49.14 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  46.64 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  45.8 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  47.44 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  48.09 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  48.09 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  48.09 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  48.09 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  49.11 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  48.09 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  45.8 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  47.9 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  47.9 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  45.38 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  46.03 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  44.96 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  43.4 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  42.86 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  44.68 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  45.42 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  43.57 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  41.35 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  42.26 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  42.26 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  44.87 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  41.2 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  41.2 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  43.4 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  44.03 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  39.33 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  40.34 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  40.34 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  40.34 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  40.34 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  39.42 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  43.35 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  41.13 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  41.63 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  38.82 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  39.06 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  39.06 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  39.06 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  39.06 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  40.34 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  39.83 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  39.06 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  38.59 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  39.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  36.91 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  31.68 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  30.28 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  31.03 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  32.67 
 
 		 592 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  32.3 
 
 		 574 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  28.63 
 
 		 598 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  26.67 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  29.76 
 
 		 574 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  29.51 
 
 		 584 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  31.68 
 
 		 580 aa  86.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  29.24 
 
 		 574 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  31.47 
 
 		 576 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 577 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  30.24 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  28.78 
 
 		 578 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  29.67 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 614 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  29.39 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  28.78 
 
 		 594 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  28.78 
 
 		 578 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  31.58 
 
 		 563 aa  78.6  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  28.22 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 588 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  31.16 
 
 		 570 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  28.34 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  29.85 
 
 		 576 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  29.85 
 
 		 576 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  30.37 
 
 		 580 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  32.34 
 
 		 571 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  27.62 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  27.62 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  29.24 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  27.45 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  30.77 
 
 		 582 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  29.85 
 
 		 570 aa  72  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  28.02 
 
 		 578 aa  72  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.89 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  23.94 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  30.2 
 
 		 557 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>