130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2233 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  75.81 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  75.3 
 
 		 252 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  74.9 
 
 		 252 aa  380  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  74.9 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  71.66 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  70.85 
 
 		 254 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  70.85 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  69.01 
 
 		 249 aa  362  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  70.45 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  70.45 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  69.96 
 
 		 246 aa  358  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  66.12 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  66.53 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  68.6 
 
 		 260 aa  338  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  58.92 
 
 		 245 aa  294  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  58.51 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  57.85 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  60.68 
 
 		 245 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  58.51 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  60.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  60.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  60.68 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  58.51 
 
 		 245 aa  291  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  58.51 
 
 		 245 aa  291  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  58.92 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  58.51 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  60.68 
 
 		 245 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  61.54 
 
 		 245 aa  289  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  61.97 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  61.97 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  56.43 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  55.98 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  48.99 
 
 		 250 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  46.75 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  45.19 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  48.21 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  45.16 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  45.49 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  42.39 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  42.8 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  43.1 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  41.28 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  43.83 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  41.22 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  44.44 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  42.06 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  41.45 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  41.42 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  39.41 
 
 		 240 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  41.15 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  36.48 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  32.48 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  30.57 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  25.49 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  28.57 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  28.93 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  26.74 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  28.76 
 
 		 580 aa  72.4  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.54 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  28.02 
 
 		 574 aa  69.3  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  31.14 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  24.39 
 
 		 594 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  24.39 
 
 		 578 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  29.52 
 
 		 578 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  30.95 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  30.25 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  28.02 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  30.91 
 
 		 586 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  29.52 
 
 		 578 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  24.7 
 
 		 598 aa  58.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  29.56 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  27.73 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  30.69 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  23.37 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  28.92 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  28.5 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  27.19 
 
 		 586 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  27.4 
 
 		 588 aa  55.8  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  27.07 
 
 		 577 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  28.92 
 
 		 574 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  25 
 
 		 584 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  27.57 
 
 		 614 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  26.92 
 
 		 557 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  28.87 
 
 		 560 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 570 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  25.1 
 
 		 574 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  30 
 
 		 563 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  35.05 
 
 		 558 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  25.3 
 
 		 570 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1038  histidinol-phosphatase  24.54 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>