180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4386 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  66.67 
 
 
650 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1798  family X DNA polymerase IV  77.87 
 
 
589 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  66.84 
 
 
614 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4147  PHP-like  78.01 
 
 
591 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3642  phosphotransferase domain-containing protein  79.06 
 
 
592 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4219  phosphotransferase domain-containing protein  78.01 
 
 
591 aa  839    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257415  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  65.98 
 
 
642 aa  721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  65.21 
 
 
740 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4117  phosphotransferase domain-containing protein  78.71 
 
 
592 aa  836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4386  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
588 aa  1155    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3298  phosphotransferase domain-containing protein  78.01 
 
 
591 aa  839    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.565465  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  56.12 
 
 
580 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  55.5 
 
 
574 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  54.53 
 
 
574 aa  581  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0820  phosphotransferase domain-containing protein  56.37 
 
 
575 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  52.26 
 
 
598 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  51.57 
 
 
576 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  51.57 
 
 
576 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  50.18 
 
 
574 aa  538  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  52.6 
 
 
582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  52.6 
 
 
582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  43.63 
 
 
594 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  43.63 
 
 
578 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  44 
 
 
574 aa  479  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  44.66 
 
 
576 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  41.68 
 
 
578 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  38.76 
 
 
570 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  41.77 
 
 
578 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  38.72 
 
 
580 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  42.36 
 
 
576 aa  425  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  41.11 
 
 
577 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  39.62 
 
 
584 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  37.3 
 
 
570 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  40.14 
 
 
588 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  42.46 
 
 
576 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  41.19 
 
 
579 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  42.48 
 
 
578 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  38.57 
 
 
570 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  34.15 
 
 
573 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  35.38 
 
 
584 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  35.99 
 
 
582 aa  369  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  36.93 
 
 
584 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  40.77 
 
 
589 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  41.1 
 
 
580 aa  361  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  41.87 
 
 
580 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  41.14 
 
 
580 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  39.19 
 
 
560 aa  356  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  35.09 
 
 
569 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  39.86 
 
 
583 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  40.65 
 
 
586 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  40.42 
 
 
562 aa  345  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  38.29 
 
 
592 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  41.36 
 
 
592 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  40.66 
 
 
592 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  31.86 
 
 
571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  40.84 
 
 
592 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  35.52 
 
 
572 aa  337  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2986  PHP domain protein  39.83 
 
 
577 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  37.87 
 
 
569 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  35.4 
 
 
573 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  35.57 
 
 
573 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  35.57 
 
 
572 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  37.22 
 
 
562 aa  333  7.000000000000001e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  35.57 
 
 
573 aa  333  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  35.57 
 
 
572 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  35.57 
 
 
572 aa  332  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  35.82 
 
 
557 aa  332  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  35.05 
 
 
572 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  35.4 
 
 
573 aa  329  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  38.21 
 
 
574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  35.22 
 
 
572 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  35.22 
 
 
572 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 
586 aa  324  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  35.05 
 
 
572 aa  324  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  32.29 
 
 
576 aa  320  5e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  41.54 
 
 
586 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  37.22 
 
 
560 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0442  PHP domain protein  37.29 
 
 
605 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.372194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  36.22 
 
 
543 aa  293  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  36.97 
 
 
578 aa  279  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  29.35 
 
 
569 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  28.88 
 
 
570 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  28.88 
 
 
570 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  33.8 
 
 
532 aa  257  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  35.82 
 
 
536 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  30.3 
 
 
566 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  30.41 
 
 
572 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  29.17 
 
 
563 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  29.53 
 
 
577 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  27.18 
 
 
558 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  27.54 
 
 
557 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2809  phosphotransferase domain-containing protein  40.57 
 
 
621 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102526  hitchhiker  0.000714673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  32.82 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  41.64 
 
 
650 aa  191  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  39.24 
 
 
339 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  36.99 
 
 
356 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  36.33 
 
 
356 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  35.71 
 
 
337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  32.92 
 
 
344 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>