More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0117 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 271 aa  560  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  85 
 
 		 271 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  80.15 
 
 		 293 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  80.15 
 
 		 293 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  80.15 
 
 		 293 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  80.84 
 
 		 269 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  78.29 
 
 		 276 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  68.65 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  63.3 
 
 		 279 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  62.26 
 
 		 274 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  63.86 
 
 		 261 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  65.06 
 
 		 271 aa  341  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  60.53 
 
 		 274 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 		 274 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  62.99 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  61.36 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  62.89 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  62.99 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  60.07 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  62.89 
 
 		 277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  61.33 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  61.57 
 
 		 278 aa  335  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  60.07 
 
 		 274 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  59.55 
 
 		 271 aa  334  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  61.81 
 
 		 278 aa  334  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  60.31 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  62.6 
 
 		 276 aa  331  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  60 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  60.61 
 
 		 279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  60 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  60.31 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  56.98 
 
 		 276 aa  322  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  59.84 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  58.69 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  58.66 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  58.54 
 
 		 284 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  58.54 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  58.13 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  56.4 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  56.91 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  55.2 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  59.27 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  55.91 
 
 		 259 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  55.51 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  54.44 
 
 		 260 aa  289  4e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  60.17 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  57.81 
 
 		 255 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  55.56 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.56 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  57.49 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  57.49 
 
 		 260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  54.62 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  54.75 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  56.25 
 
 		 260 aa  281  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  55.83 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  53.49 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  57.5 
 
 		 260 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  53.31 
 
 		 266 aa  278  7e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  57.5 
 
 		 260 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  58.05 
 
 		 258 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  57.5 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  53.05 
 
 		 267 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  57.5 
 
 		 260 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  55.74 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  56.25 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  51.92 
 
 		 269 aa  271  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51.72 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  54.1 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  54.9 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  55.88 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  52.31 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  55.19 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  52.09 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.96 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  52.09 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.050606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>