More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2311 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  393  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  44.24 
 
 
199 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1057  alkaline phosphatase  41.57 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000034861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  30.98 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  29.7 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0441  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.46 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  27.23 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  29.35 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  29.65 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  30.98 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.96 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  31.84 
 
 
197 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  33.33 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  31.52 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4843  dedA family protein  31.84 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  33.33 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  33.33 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  33.33 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  33.33 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  34.52 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  35.33 
 
 
204 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  35.33 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  35.33 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  31.48 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  35.33 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  34.73 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  34.73 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  34.73 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  34.73 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  34.73 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  28.36 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  27.78 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  27.78 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 
215 aa  85.1  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  29.94 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  29.94 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  29.94 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  29.94 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  29.94 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  29.94 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.31 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  27.85 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.4 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.68 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  28.75 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.81 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  29.09 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.2 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  26.88 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.03 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  27.39 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.63 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  27.98 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.24 
 
 
202 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  26.79 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  26.79 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  29.33 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  26.79 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  26.79 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  26.79 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.27 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.04 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  28.4 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  25.38 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  27.27 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  26.19 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.53 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  26.19 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  26.19 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.07 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.86 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  25.45 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  28.04 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.27 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  28.48 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.76 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  30.41 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  27.95 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>