34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1024 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  63.57 
 
 		 265 aa  332  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  61.42 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  38.34 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  36.65 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  35.97 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  35.97 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  35.97 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  35.22 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  34.94 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  36.88 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  34.15 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  32.54 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  32.54 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  32.54 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  32.55 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  34.54 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  30.89 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  31.47 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  35.27 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  31.56 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  33.46 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  31.2 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  30.98 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  30.47 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  32.2 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  30.23 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  30.16 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  31.01 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  31.47 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  29.13 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  31.02 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  28.68 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>