More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1760 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
530 aa  1040    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  54.48 
 
 
516 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  54.11 
 
 
516 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  54.48 
 
 
516 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  54.11 
 
 
516 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  54.48 
 
 
516 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  54.29 
 
 
516 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.29 
 
 
516 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  54.48 
 
 
516 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  54.48 
 
 
516 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  54.29 
 
 
516 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  56.02 
 
 
511 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  53.74 
 
 
513 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.31 
 
 
516 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  54.8 
 
 
568 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.38 
 
 
536 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  47.84 
 
 
584 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.28 
 
 
659 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  54.43 
 
 
536 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  47.48 
 
 
584 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  47.13 
 
 
584 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  54 
 
 
537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  50.39 
 
 
519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50 
 
 
515 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.27 
 
 
557 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  52.73 
 
 
557 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.84 
 
 
534 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.14 
 
 
539 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  53.61 
 
 
532 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  53.42 
 
 
528 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  45.47 
 
 
665 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  49.22 
 
 
515 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  47.07 
 
 
664 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  47.33 
 
 
665 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  49.91 
 
 
561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  48.37 
 
 
541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.37 
 
 
541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  53.31 
 
 
546 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  48.37 
 
 
541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  52.9 
 
 
552 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  45.45 
 
 
661 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  51.83 
 
 
584 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  50.75 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  47.67 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  50.97 
 
 
528 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  46.37 
 
 
584 aa  445  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  52.03 
 
 
542 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  52.45 
 
 
536 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.48 
 
 
516 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  54.25 
 
 
524 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  47.53 
 
 
554 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  50.66 
 
 
543 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  52.08 
 
 
540 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.93 
 
 
541 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.93 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.9 
 
 
538 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  51.04 
 
 
552 aa  442  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.93 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.93 
 
 
543 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  47.15 
 
 
554 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  47.17 
 
 
554 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  52.85 
 
 
538 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  50.85 
 
 
545 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  45.47 
 
 
659 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  45.85 
 
 
554 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.51 
 
 
508 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.51 
 
 
508 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.93 
 
 
543 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  46.67 
 
 
554 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  46.34 
 
 
657 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  50.86 
 
 
525 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  45.52 
 
 
577 aa  434  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  50.56 
 
 
551 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  47.46 
 
 
549 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  47.46 
 
 
549 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  45.92 
 
 
552 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  47.46 
 
 
549 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  45.64 
 
 
552 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  47.46 
 
 
549 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  46.92 
 
 
563 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  46.12 
 
 
551 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  47.46 
 
 
549 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  46.31 
 
 
551 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  47.65 
 
 
549 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  46.31 
 
 
552 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  47.27 
 
 
549 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  45.93 
 
 
552 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  47.02 
 
 
559 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  45.74 
 
 
552 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  45.83 
 
 
552 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  50.85 
 
 
537 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  45.31 
 
 
662 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  45.82 
 
 
552 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>