More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1245 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  66.19 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  64.61 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  64.23 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  59.02 
 
 		 266 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  54.29 
 
 		 280 aa  278  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3546  undecaprenol kinase  59.09 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  53.82 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  47.83 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  47.04 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  47.04 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.04 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.98 
 
 		 278 aa  209  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.27 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  43.92 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  43.23 
 
 		 305 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  42.91 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  45.77 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  43.43 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.53 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.08 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  45.1 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.84 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.21 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  44.66 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  42.21 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  42.13 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.44 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.54 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  40.89 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.34 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  43.94 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  42.23 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  39.03 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  39.03 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  41.67 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  41.37 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.97 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.98 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.98 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  44.18 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  43.67 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  40.68 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  43.31 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.59 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  41.34 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.56 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  42.63 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.96 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  42.75 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.84 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.96 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.86 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.87 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.6 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  39.62 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  39.41 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.62 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  40.78 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.48 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.48 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  41.26 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.78 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  40.87 
 
 		 268 aa  184  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  41.38 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  36.65 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3908  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.25 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1436  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.25 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.648301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  39.37 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  39.54 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  40.36 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  40.24 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1296  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.25 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00356905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.25 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.25 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1403  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.25 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.3 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>