226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1121 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1121  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.713448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0144  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  76.56 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0448157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.56 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1701  twin arginine translocase protein A  84.91 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0480463  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0399  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.13 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.38 
 
 
62 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2177  twin arginine-targeting protein translocase  68.42 
 
 
62 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000333643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.03 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  50.88 
 
 
59 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.85 
 
 
57 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  65.45 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  60 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  40.62 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3217  twin-arginine translocation protein TatA/E  64.29 
 
 
61 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.6697199999999997e-20  hitchhiker  0.000106815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.85 
 
 
55 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  62.22 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  62.22 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3190  twin arginine-targeting protein translocase  54.84 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  64.44 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  49.12 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  53.45 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.03 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.03 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.03 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  62.22 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.06 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.24 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0148  twin arginine translocase protein A  56.25 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.78 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  65 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  44.12 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  39.73 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0132  twin arginine translocase protein A  56.25 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.43 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  45.16 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  47.46 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  39.39 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  38.36 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  59.26 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3167  twin arginine translocase protein A  50.72 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000551363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  54.17 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.47 
 
 
62 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  62.5 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  42.37 
 
 
60 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  57.14 
 
 
207 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  44.83 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  53.49 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  49.02 
 
 
55 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0045  twin arginine translocase protein A  62 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.895264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.27 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 
57 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.11 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.11 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  48.84 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.38 
 
 
116 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.78 
 
 
152 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.24 
 
 
214 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.51 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  39.73 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  38.03 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.68 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.16 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  55.88 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  48.89 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.97 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.89 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1700  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.85 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  42.25 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  45.45 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.48 
 
 
69 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  45.65 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  51.11 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  47.92 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.78 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  39.44 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.91 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>