229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1724 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.11 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0144  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  70.97 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0448157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.88 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1121  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  65.45 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.713448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1701  twin arginine translocase protein A  71.15 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0480463  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2177  twin arginine-targeting protein translocase  80.56 
 
 
62 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.26 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0399  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  67.5 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  46.43 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  51.06 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  40.85 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  55 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  44.44 
 
 
81 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  51.22 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.28 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.28 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.28 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  52.08 
 
 
73 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  53.19 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.37 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  52.08 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.09 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  50.98 
 
 
73 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  52.27 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  55 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  45.76 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.27 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  43.1 
 
 
60 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
94 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  47.92 
 
 
76 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  42.37 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  47.92 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  43.75 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0289  twin arginine translocase protein A  64.86 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  38.6 
 
 
59 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.63 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  45.83 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  52.38 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.46 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  48.94 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  45.83 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  53.33 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  40.43 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.27 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  56.76 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>