More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1403 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
381 aa  800    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.4 
 
 
383 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
384 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
383 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  66.14 
 
 
383 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  66.14 
 
 
383 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.14 
 
 
383 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.14 
 
 
383 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.41 
 
 
380 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.14 
 
 
383 aa  424  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.92 
 
 
391 aa  378  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.49 
 
 
377 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  46.44 
 
 
378 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  46.7 
 
 
378 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
380 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.19 
 
 
383 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  41.88 
 
 
385 aa  316  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
383 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  40.99 
 
 
384 aa  292  5e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.74 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.86 
 
 
385 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.7 
 
 
394 aa  255  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.56 
 
 
399 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0538412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2442  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.48 
 
 
395 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.830058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.28 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.9 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.17 
 
 
379 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.28 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.38 
 
 
380 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  31.95 
 
 
410 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  32.89 
 
 
388 aa  194  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.51 
 
 
404 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.26 
 
 
386 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.51 
 
 
404 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.51 
 
 
404 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
376 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.19 
 
 
396 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
381 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
381 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
376 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
376 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
376 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.73 
 
 
382 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
376 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
381 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 
376 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.87 
 
 
380 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 
375 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0668  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.9 
 
 
379 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.73 
 
 
376 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.72 
 
 
375 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.71 
 
 
376 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.33 
 
 
379 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  31.17 
 
 
410 aa  189  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.23 
 
 
379 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.583783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.02 
 
 
400 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2926  acyl-CoA dehydrogenase  31.45 
 
 
390 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1147  acyl-CoA dehydrogenase  31.45 
 
 
390 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.94 
 
 
385 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.11 
 
 
389 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2771  acyl-CoA dehydrogenase  31.45 
 
 
390 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1226  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.32 
 
 
381 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
375 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.2 
 
 
377 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3267  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.23 
 
 
379 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.691288  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.64 
 
 
388 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.76 
 
 
386 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3396  acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 
351 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581792  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.84 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2429  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.78 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.43 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.78 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  31.25 
 
 
417 aa  184  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  30.65 
 
 
410 aa  184  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.47 
 
 
389 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2106  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.79 
 
 
381 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.19 
 
 
405 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0626  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.59 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000265202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.53 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>