33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3754 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  79.1 
 
 		 511 aa  825    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 508 aa  1054    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  53.32 
 
 		 523 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  46.71 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  45.22 
 
 		 511 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  42.66 
 
 		 520 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.07 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  42.27 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  43.06 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  42.86 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  41.16 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40.3 
 
 		 539 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.62 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  39.61 
 
 		 564 aa  320  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  36.07 
 
 		 529 aa  316  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  37.12 
 
 		 521 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.18 
 
 		 535 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  39.13 
 
 		 534 aa  299  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  35.13 
 
 		 528 aa  259  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  31.71 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.17 
 
 		 546 aa  231  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.8 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  33.05 
 
 		 534 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.98 
 
 		 529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.77 
 
 		 529 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.75 
 
 		 555 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  27.16 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  21.55 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  26.45 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  26.13 
 
 		 502 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.87 
 
 		 502 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.66 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.29 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>