33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0928 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 
502 aa  1045    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  98.61 
 
 
502 aa  1038    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  97.01 
 
 
502 aa  1023    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  52.71 
 
 
506 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  24.65 
 
 
488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  22.89 
 
 
528 aa  93.6  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  26.49 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  27.42 
 
 
564 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.35 
 
 
534 aa  91.3  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  21.28 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  20.89 
 
 
520 aa  87  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.52 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  27.01 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  26.75 
 
 
518 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.51 
 
 
539 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  19.96 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  25.4 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  26.43 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  25.16 
 
 
511 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.68 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.09 
 
 
529 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  25.16 
 
 
519 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  24.67 
 
 
521 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.73 
 
 
535 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.97 
 
 
529 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.87 
 
 
546 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.45 
 
 
540 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  25 
 
 
555 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.63 
 
 
533 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.87 
 
 
508 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.22 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.73 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>