30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0174 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 555 aa  1112    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.02 
 
 		 534 aa  299  8e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  37.75 
 
 		 546 aa  282  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  31.92 
 
 		 528 aa  270  7e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.05 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.87 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  32.85 
 
 		 521 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.33 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  35.34 
 
 		 534 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.21 
 
 		 560 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  32.67 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.52 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  30.39 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.63 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  29 
 
 		 529 aa  224  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.7 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  30.13 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  30.2 
 
 		 511 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.54 
 
 		 511 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  32.34 
 
 		 518 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  32.52 
 
 		 518 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.1 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.91 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.73 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.75 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  31.48 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  26.17 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  25.14 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25 
 
 		 502 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  24.04 
 
 		 502 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>