33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3062 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  97.12 
 
 		 520 aa  1041    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  73.51 
 
 		 518 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  69.78 
 
 		 519 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  74.3 
 
 		 518 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  96.35 
 
 		 520 aa  1037    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 520 aa  1074    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  48.3 
 
 		 523 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  47.83 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  45.33 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  44.97 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.66 
 
 		 508 aa  415  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  43.28 
 
 		 539 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  40.78 
 
 		 521 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  39.51 
 
 		 529 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  41.83 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40.15 
 
 		 535 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  39.85 
 
 		 564 aa  342  9e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  38.03 
 
 		 528 aa  336  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  39.11 
 
 		 534 aa  332  9e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  35.25 
 
 		 532 aa  270  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.23 
 
 		 546 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  34.3 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.53 
 
 		 529 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  32.76 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.85 
 
 		 560 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.1 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  20.74 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  25 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  19.96 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  20.16 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.49 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  23.27 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.67 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>